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工程师用AI给狗设计疫苗,肿瘤六周缩小一半

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大数据文摘受权转载自夕小瑶科技说

这周末,我在 X 上看到了一个故事。很炸。原帖阅读量已经冲到了1200 万 +。


一个叫 Paul Conyngham 的澳洲老哥,家里的狗Rosie被确诊为晚期皮肤癌。肿瘤已经长到网球那么大,兽医基本判了死刑,说它可能只剩下几个月时间。

可这哥们没接受这个结局。作为一个做了 17 年机器学习的工程师,他决定拿 ChatGPT 和 mRNA 技术 给狗设计一款个性化癌症疫苗。

六周后。那个被判死刑的肿瘤,缩小了一半。

这是 Rosie 治疗前后大腿内侧的对比照片:


连参与其中的新南威尔士大学 Ramaciotti 基因组中心主任、计算生物学副教授 Martin Smith 都忍不住说:“Holy crap, it worked!”

这事现在已经上了澳大利亚国家电视台。


甚至连马斯克都忍不住下场转发,顺手还要抢一句功劳,强调这事的主要功臣其实是 Grok。


当然,一个完全没有生物学背景的人,自己搞疫苗,这种故事谁看了都会先在心里打个问号。评论区也果然吵翻了天。

所以我去翻了 Paul 本人的 X 帖子,也看了澳洲媒体的报道。我们来复盘一下这个事情,万一以后有机会你能用上呢。

先说结论。这事肯定不是假的,但也绝对没有网上传得那么邪乎。

Rosie 是 2019 年被领养的。那时候它被遗弃在灌木丛里,刚好赶上疫情封锁,成了 Paul 最重要的陪伴之一。

2022 年就发现头上长了一些奇怪的肿块,兽医当时说只是疣。结果到了 2024 年,Rosie 直接被诊断出肥大细胞肿瘤。兽医给出的判断已经很悲观了。大意就是,能做的不多,情况不乐观,接下来大概率只能尽量拖时间。

很多人走到这里,可能就接受现实了。但 Paul 没认。

他在 X 上把这件事定义成一个近乎不可能的目标:用机器学习和更先进的方法,把 Rosie 从死亡线上拉回来。


第一阶段,是搞到数据。

基因测序设备几百万美元一台,普通人根本摸不到。这时候他动用了创业技能。

到处打电话,发消息,找人脉。

结果,他通过朋友引荐联系上了 Elita Genetics 的人,得到了第一波建议:Rosie 需要做活检,需要提取并保存 mRNA,还应该去找更专业的犬类癌症方向资源。与此同时,Paul 也没闲着,已经开始搭自己的数据处理 pipeline,找已有的犬类基因组数据库,准备后续分析。

也就是在这个阶段,AI 真正开始上场。Paul 开始用 ChatGPT 帮自己头脑风暴治疗路线。

ChatGPT 给他指向了免疫治疗,并把他引到新南威尔士大学的 Ramaciotti 基因组中心。

副教授 Martin Smith 回忆说,第一次见到这个请求时,他是拒绝的。他们通常不支持直接面向消费者的测序,因为生成数据容易,解读数据很难。

但 Paul 的回复让他愣住了:“没关系,我是数据分析师,我自己能搞定,ChatGPT 会帮我。”

Smith 决定给他一次机会。Smith 建议用 Illumina 机器做全基因组测序,费用大约 3000 美元,周期 10 天;正常组织做 30x 深度,癌组织做 60x 深度,因为要更高深度才能看清肿瘤突变。

巧合的是,之前 ChatGPT 在聊天里就建议过他去联系 Elita 或 Martin Smith,并推荐用 Illumina。


拿到数据后,Paul 开始疯狂自学。

他用各种数据 pipeline 找突变,用 AlphaFold 分析蛋白质结构,找靶点,匹配药物。然后,他拿着半页纸的配方,又去找 Smith。

Smith 直接震惊了,Paul 完全是外行,没有生物学背景,但他凭借自己的数据分析能力,硬是把 AlphaFold 和相关算法用起来,找出了关键突变、靶点,甚至还问我能不能帮忙合成他筛出来的候选化合物。

但这条路第一次并没有直接通向成功。

他先瞄准了现成的免疫药物,结果药厂直接拒绝了申请。那一刻,他几乎要放弃了,气馁到不行。

也正是在这个节点, Smith 告诉他,还有另一条路:mRNA 疫苗。

Ramaciotti 团队联系了 UNSW RNA Institute 的主任 Pall Thordarson。这位冰岛教授是纳米医学先驱,他用 Paul 压缩到半页公式级别的数据,给 Rosie 做出了全球首款个性化犬类癌症疫苗,而且这件事仍然处在癌症免疫治疗的最前沿。

但最难的部分还没来。

在澳大利亚,不可能让你随便做个疫苗就往动物身上打,一切都得按规矩来。为了跑通这件事,他前后花了三个月时间,写出了一份超过百页的伦理申请材料。

命运的第二次垂青,也是在这里出现的。

美国 Canine Cancer Alliance 的创始人 Mari Maeda 看到了 UNSW 网站上关于 Paul 的故事,把他引荐给了昆士兰大学兽医学院的 Rachel Allavena 教授。她的研究项目正好拥有实验治疗伦理许可。

于是疫苗冷链运到了昆士兰,Paul 开了 10 小时车,带 Rosie 去打了第一针、第二针。

六周后。那个网球大小的肿瘤,缩小了一半。虽然目前还是没有痊愈,但 Rosie 的毛发重新有了光泽,精神好了,甚至能去狗公园追兔子了。


你从我的讲述中,也能感觉到整个治疗过程的成本非常高。金钱、时间、人脉,单拿出来一个我们普通人都很难复刻。

可它依然很重要。

AI 让外行有了快速入门的能力,让普通人可以撬动整个学术界。

当然,这种撬动是有代价的。Paul 花了数万美元,赌上了 Rosie 的命,也赌上了自己的声誉。如果失败了,他就是一个用 AI 瞎搞差点害死狗的疯子。

但他赌赢了。

就像《肖生克的救赎》里那句,“记住,希望是件好东西,也许是世间最好的东西,而好东西是永远不会消亡的。”

在 Paul 的故事里,希望不是盲目的。

有时候,救你的不是医生,是你自己不想放弃的那股劲儿。而 AI,只是让这股劲儿,有了更大的杠杆。

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