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监测预警基础32-北京流感实战案例,手把手拆解综合指数法6步操作!

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系列简介

这是我们一系列原创技术贴,从易到难,每天学习一点。所有内容均为疾控数据分析、科研论文相关,或者说很多和现在的热门监测预警相关,所以我们这个系列就叫“监测预警基础”。

今天是第32节,综合指数法按照步骤说起来难度并不大,但是中间几步其实可采用的具体方式也比较多,我们不可能一篇全部讲完。

所以,今天我们以北京市疾控中心2018年发表在中华流行病上的一篇文章为例,当然,不是说这篇文章用的所有方式和方法现在看起来都非常完美,但是也是一篇综合指数法应用于流感的经典文章,我们以此来拆解综合指数法的6步操作,在这个过程中我们也会指出除文章采用的方式外还有哪些方式方法。


本文仅对该文章进行学习,思考,目的是介绍综合指数法的步骤和方法,如有侵权,欢迎留言指出,我们将及时删文。

如有不当之处,欢迎留言讨论。

北京市疾控中心用一套方法,把流感样病例(ILI)、流感病毒核酸检测阳性率、流感聚集性疫情起数这三个“各说各话”的指标,捏合成一个每周更新的综合指数(I),并切出了五级流行强度。


北京案例最终只选了3 个指标,但覆盖了三个完全不同的维度:


为什么选 3 个?不是越多越好,而是“刚好够交叉验证”。病例数告诉你“总量在涨”,阳性率告诉你“确实是流感在涨而不是普通感冒”,聚集性疫情告诉你“已经从散在传播升级到成簇传播”。三者组合,基本能过滤掉单一指标的随机噪音。

选指标其实非常重要,为此我们昨天专门有一节内容阐述这个问题

其他可选指标:诺如预警常用“病原阳性率+聚集性疫情起数”;新冠时期可纳入发热门诊量、污水监测 Ct 值等。核心原则:选2~4 个、维度独立、每周可更新的指标。


综合指数法选好指标之后的一步就是去量纲。

为什么?

因为三个指标单位完全不同(人次、%、起数),必须各自除以一个“标准值”,才能变成可相加的相对倍数。所以这一步的难点和重点就是这个标准值从何而来?

北京案例里,三个标准值是这样确定的:

① 流感样病例数标准值:12 000 例/周

  • 先算出北京市近 4 个流行季(2013—2017)的流感样病例预警基线值 11 527 例/周;

  • 结合北京实际监测网络覆盖情况,最终把标准值定为12 000 例/周。

② 流感病毒核酸检测阳性率标准值:20%

  • 先找出近 4 个流行季每周阳性率的年度最大值,分别为 54.13%、69.25%、53.67%、41.89%;

  • 以此计算得出21.89%作为流感流行期与非流行期的界值;(最大值均值的40%)

  • 最终确定20%作为该指标的标准值。

③ 流感聚集性疫情标准值:2 起/周

  • 先用阳性率 20% 这个界值,把历史数据切成“流行期”和“非流行期”;

  • 再算近 4 个流行季里,流行期的聚集性疫情周平均值(2.2 起/周);

  • 最终取整为2 起/周。

你发现没,北京的专家是怎么做的,其实就是“历史数据+专家评估”来定标准值。除此之外,你还可以采用以下方法,这些方法的具体操作我们前面的内容都分享过。

MEM(移动流行区间法):用 5 年以上周数据自动算出流行阈值,最客观,但仅限周数据;

Serfling 回归:拟合一条带季节波动的动态基线,每周标准值都不同,适合强季节性疾病;

CUSUM/专家经验:前者灵敏探测早期异常,后者适合刚起步、数据不足的系统。


有了标准值,标化就很简单。

北京案例用的是最直观的标准值法:相对值 = 本周实际值 ÷ 标准值

比如某周:

  • ILI 实际 18 000 例 → 18 000 / 12 000 =1.5

  • 阳性率实际 30% → 30% / 20% =1.5

  • 聚集性疫情实际 4 起 → 4 / 2 =2.0

这3个倍数现在单位统一了,都是“相对于标准的几分之几”,可以直接加权,我们的最终指数也就要呼之欲出了。

当然,除此之外,还有其他标化方法,比如:

Min-Max 法:(X - Xmin) / (Xmax - Xmin),把数据压到 0~1;

Z-Score 法:(X - μ) / σ,适合正态分布数据;

均值归一化法:结合 Min-Max 和 Z-Score 的特点。

为什么疾控常用标准值法?

因为标化后的倍数天然带有公共卫生意义:>1 就是“超标准了”,0.5 就是“只有标准的一半”,不需要二次翻译。


这一步其实很关键,凭什么某个指标权重高,某个低?谁说了算?

北京案例的权重是专家评估法确定的,最终结果为:


注意:三个权重加起来必须等于 1。这里前两个指标平分秋色,聚集性疫情作为“社会面升级信号”占 0.2,既不被忽视,也不喧宾夺主。

当然,还有其他权重确定方法,比如:

德尔菲法:背对背多轮专家打分,适合本地专家经验丰富时;

层次分析法(AHP):两两比较指标重要性,通过一致性检验(CR<0.1)确保逻辑自洽;

熵权法:纯数据驱动,指标波动越大权重越高,最客观,但需要较长历史数据。

我们的实务建议:不要直接抄北京这篇的 0.4/0.4/0.2。甲市和乙市的监测网络、就诊习惯不同,权重需要本地化。数据充足时,建议熵权法+专家评估组合使用,既客观又贴合实际。


综合指数的计算公式非常简单:

I = Σ [ Wi × ( Xi / Mi ) ]

代入上面的例子:

I=0.4 ×1.5+0.4×1.5+0.2×2.0=1.6

这个1.6就是当周的流感综合风险分值。

北京2013—2017年共209周的实际结果显示:综合指数I值范围为0.27~3.94,中位数0.46,四分位距0.36~1.01,偏度为 2,呈右偏分布,即大多数时间风险较低,少数时间很高。


算出指数后,必须“切几刀”,对应到不同防控响应。北京案例根据 209 周数据的分布特征(中位数、偏度、四分位距)结合专家评估,切出了五级:


注意:北京 209 周里,5 级(I>4)一次都没出现,4 级也只出现了 8 周(3.83%)。

这说明阈值切得合理——既不会天天狼来了,也不会漏掉真正的高风险时段。

当然,现在很多人也用以下方法来切一切:

MEM 法:把综合指数当成单一指标,用移动流行区间法直接算出流行阈值和中位/高强度/超高强度阈值;

百分位数法:用历史综合指数的中位数、75%、90%、95% 分位数作为切点;

专家研讨法:结合本地防控资源和响应能力,对数据切分结果进行人工校准。

好的,到此为止,综合指数法的操作步骤就是这么简单。

北京这篇经典案例告诉我们:综合指数法不是高科技,而是一套“选准指标→定好尺子→加权求和→分级响应”的标准化流程。它的威力不在于算法复杂,而在于把“门急诊在喊、实验室在报、学校在暴发”这三类声音,翻译成一句统一的、有刻度的、可行动的预警结论。


参考文献和书籍:

[1]杨鹏, 王小莉. [M]传染病预测预警技术及实践案例分析.[M] 人民卫生出版社: 267-275.

[2] 张莉, 吴双胜, 石伟先, 等. 综合指数法建立北京市流感流行水平分级评价体系的研究[J]. 中华流行病学杂志, 2018, 39(8): 1096-1099. DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2018.08.016.


编辑:普通疾控人 | 审核:诗酒趁年华

文章来源 | 原创

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