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《自然》子刊:“封印”乙肝病毒的疗法诞生!科学家开发表观遗传基因编辑疗法,可有效抑制体内乙肝病毒转录,临床试验已开始

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据世界卫生组织(WHO)最新报告,全球约有2.5亿慢性乙型肝炎(CHB)患者,每年因乙肝相关的肝硬化和肝细胞癌(HCC)死亡的人数超过100万。

目前临床一线的核苷(酸)类似物(NUCs)虽然能有效抑制病毒复制,但极少能实现功能性治愈(即停药6个月后HBsAg持续阴性且检测不到HBV DNA)。

乙肝持久难愈的根源在于肝细胞内存在两大“病毒储备库”:共价闭合环状DNA(cccDNA)作为病毒转录与复制的原始模板,是乙肝病毒持久存在的根本驱动力;整合入宿主基因组的整合HBV DNA(intDNA),持续表达乙肝表面抗原(HBsAg),导致宿主免疫耗竭与免疫耐受。

RNAi疗法仅在转录后阶段暂时降解RNA,停药后易反弹;而传统的基因编辑则面临DNA双链断裂、染色体重排及异位整合等安全风险。

今日,《自然·生物医学工程》杂志发表论文,研究者们开发出针对表观遗传学的基因编辑疗法CRMA-1001,通过脂质纳米颗粒(LNP)递送定点DNA甲基化效应蛋白,在不剪切DNA的前提下,实现了对cccDNA和intDNA的持久转录封禁,推动慢性乙肝迈向有限疗程的功能性治愈。


研究者对7000条HBV全基因组序列进行分析,设计了121条靶向gRNA。筛选出的HBV-gRNA2在超过8000条HBV基因组中保守率达94%,且能引发最高水平的CpG岛高甲基化。

CRMA-1001由LNP包裹的编码表观效应融合蛋白的mRNA与HBV-gRNA2构成。效应蛋白包含催化失活的DNA结合域(dSpCas9)、转录抑制域(KRAB)以及DNA甲基化催化域(DNMT3A/DNMT3L)。gRNA引导dSpCas9锁定病毒DNA靶区,利用细胞内源机制在靶点两侧±1.5 kb范围内的高CpG密度区密集植入DNA甲基化。

LNP递送的mRNA和gRNA在7天内完全降解,但其诱导的甲基化印记在肝细胞增殖再生后依然稳定遗传,实现持久转录封禁,且完全不引发DNA双链断裂。

研究者以PCSK9为替代靶点对表观效应融合蛋白进行了结构优化,优化后的EE7000效力较早期版本提升约4倍,在非人灵长类体内单次给药后对PCSK9的抑制作用持续超过2年。

研究者在含有整合HBV基因组的Tg-HBV转基因小鼠中测试了表观遗传编辑的效果,单次注射可将HBsAg最大降低2.7 log10,HBV DNA降低2.9 log10,疗效维持长达7个月,且高剂量组中11/15只小鼠实现了HBsAg转阴并产生乙肝表面抗体。肝脏免疫组化显示,高剂量组98%的肝细胞HBcAg呈阴性。搭载了优化效应器EE7000的最终候选药CRMA-1001展现出更强的抑毒效力,其HBsAg降低幅度较早期版本再提升约1.3 log10。

在HBV感染的人原代肝细胞中,CRMA-1001使HBsAg和HBeAg分泌减少98%,并将cccDNA上CpG岛II的甲基化水平从对照组的0.01%–0.39%提升至最高66.42%。在AAV-HBV小鼠模型中,单次给药实现31%的小鼠HBsAg与HBV DNA双转阴;每4周给药一次(共3次,Q4W×3)后,高剂量组双转阴率高达90%。

此外,CRMA-1001与恩替卡韦(ETV)展现出协同效应,能有效防止停用ETV后病毒DNA反弹。

CRMA-1001在研究中安全性表现良好,未见脱靶。研究指出,CRMA-1001直接切断了病毒转录源头,大幅降低HBsAg表达,有助于解除宿主免疫抑制,为有限疗程实现功能性治愈开辟了新路径。根据报道,CRMA-1001已于年初完成了首次人体给药,目前尚未公布试验结果。

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参考资料:

[1]Anglero-Rodriguez, Y., Xiong, Q., Cappelluti, M.A. et al. Development of an investigational epigenetic silencer therapy to transcriptionally inactivate viral DNA in chronic hepatitis B. Nat. Biomed. Eng (2026). https://doi.org/10.1038/s41551-026-01802-8


本文作者丨代丝雨

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