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张锋点赞!Anthropic公布首个AI自主科学发现,21小时零干预,Claude找到全新DNA系统

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9月23日,Anthropic正式宣布:成立生命科学研究组,自建湿实验室。


今天,该实验室同时公布了第一批成果——

Claude 在几乎没有人类指导的情况下,自主发现了一个全新的酶系统,结构特征酷似大名鼎鼎的“基因剪刀”CRISPR。


Anthropic 将其命名为ART。

整个挖掘过程由约950次Claude智能体会话接力完成,耗时21.5小时,全程没有任何人工干预。

这个系统的代表成员早在2021年就被人类科学家测序并发表了论文,但它最关键的特征,当时没有任何人注意到,直到这一次被Claude发现。

CRISPR 先驱、MIT教授张锋审阅预印本后评价:这是 AI 智能体参与生物学发现的一个令人兴奋的案例,非常值得进一步研究。

此前,Anthropic创始人兼首席执行官Dario Amodei公开表示:未来5到10年,AI有望攻克绝大多数人类疾病。



Anthropic正全速加码AI生物医学。


一道指令,AI军团干完了整个课题

先看Anthropic给Claude布置了什么任务。

研究团队用Claude Mythos 5驱动一批 Claude Code 智能体,目标是:在海量宏基因组数据中,寻找逆转录酶(RT)的新伴侣蛋白。

为了让AI像一个真正的课题组一样运转,Anthropic给它们做了明确分工:

Worker制定计划、写代码、跑分析;Supervisor审核结果,可以打回重做,也可以开新任务;Curator把每项发现录入共享知识库;Editor审阅最终报告。


智能体分工与筛选漏斗

所有记录写入版本控制系统,所有智能体共享记忆。

任务下达后,人类就撒手不管了。

结果相当惊人。Claude在19.4亿个蛋白簇中自主构建了52个搜索模型,捞出19.8万个逆转录酶簇并分成9大类。随后扫描了1万多个基因位点,从3564个候选家族中筛出17个进行深挖。

最终,它确认了3个全新的伴侣关联,否决了其余14个,还顺带发现了3个此前从未被描述过的逆转录酶谱系,ART 就是其中之一。


对一位资深专家来说,这类分析通常需要数周到数月。


科学家漏看5年,AI一眼识破

更戏剧性的细节来了。

ART 家族中有一个代表成员,来自一种叫MarsHill的金黄色葡萄球菌噬菌体,它的基因组早在2021年就已公开发表。

当时的作者识别出了这个逆转录酶,甚至推测它的上游可能存在一段非编码 RNA,但重复序列没有被发现,伴侣基因也没有被描述。

数据就这样在公共数据库里静静躺了整整5年。

这恰恰戳中了基因组挖掘领域的核心痛点。公共序列数据库的规模每四年就翻一番,如今已积累了数十亿条蛋白序列,而传统的计算流程只能按照预设的特征去“捞”,预设之外的异常天然就看不见。


图:ART与已知逆转录酶系统结构对比

真正能发现异常的,只有专家的眼睛,而专家的眼睛,恰恰是最无法规模化的资源。


像CRISPR,又不是CRISPR

人类接手之后,团队在 Claude Science 中继续深入分析,把 ART 家族扩展到了95个成员。

一个完整的ART系统由三部分组成:一个逆转录酶、一个专属的伴侣蛋白,以及一长串排列整齐的DNA重复序列。

它和CRISPR看起来很像。

CRISPR本来是细菌的免疫系统,后来被科学家改造成了基因编辑工具,也就是常说的“基因剪刀”。

但细看两个有差异。CRISPR 的间隔序列只有约30个碱基,ART则长达120到220个;ART位点附近找不到任何cas基因;此外,ART 的逆转录酶在头部有约180个氨基酸,而普通逆转录酶在同一位置通常只有50个左右。


ART结构对比

这些特征说明,ART 并不是CRISPR的某个变种,而是一种全新的非编码重复元件。

团队推测,ART 可能与细菌的抗病毒系统retron 原理相近,但retron只有一条 RNA,而ART 拥有一整个RNA库。这意味着同一个酶或许能搭配不同的 RNA,识别多种不同的威胁。

当然,Anthropic 也坦言,这个逆转录酶是否真的具备活性,目前还没有得到证明,ART在噬菌体中究竟扮演什么角色,也仍然是个未知数。


通用大模型,具备“基因组视觉”

尽管战绩亮眼,Anthropic 在论文里也毫不避讳地公开了翻车数据。

团队用完全相同的配置又跑了10次,但10次全部错过了那个关键的重复阵列,原因很简单:没有一个智能体再去读上游的原始DNA。

为了搞清楚问题究竟出在哪里,团队设计了一套专项测试,让7个Claude 模型各跑了500次。

结果出现了明显的分水岭:Opus 5.5、Mythos 5.1、Mythos 5和Opus 5这四个最强模型,全面领先于Opus 4.6、Opus 4.8 和 Sonnet 5。


七个claude模型对比

极具戏剧性的是,给 AI 的工具越多,它反而越容易看漏。

当 DNA 序列直接放在上下文里时,最强模型的识别率超过90%;可一旦换成文件+工具的模式,识别率最低跌到了32%。

原因在于,有了趁手的工具,模型就懒得去读原始数据了,在39%的尝试中,模型连一段200个碱基的连续序列都没有读过。而当Mythos 5真正读入足够长的DNA时,识别率最高可以达到96%。

值得注意的是,Anthropic 这次还动用了自家的独门绝技——可解释性研究。

团队把当时的发现过程重新输入Mythos 5,并拆解模型内部的激活信号,结果找到了两个专门对 DNA 重复序列产生反应的内部信号。在读到重复阵列之前,这两个信号保持沉默,读到第三个重复拷贝时明显增强,而一旦把碱基顺序打乱,信号几乎全部熄灭。

有意思的是,这两个信号的表现,与 Evo 2、gLM2 这类专门用 DNA 训练的基因组大模型高度相似。

可Claude是一个通用大模型,并不是专门为读基因组而设计的。

Anthropic 给这种能力起了一个颇具想象力的名字:“基因组视觉”。


对生命科学的巨大押注

同时,Anthropic终于官宣自己的湿实验室了。

生命科学负责人Kauderer-Abrams透露:生命科学部门已经发展成公司人员配备和资源最充足的部门之一。

该实验室成立于2026年春天,主要负责Anthropic的生物学研究。


宣传短片中,Anthropic展示了 白大褂、移液枪、SDS-PAGE电泳胶、离心机,这些生物实验室里最日常的东西。

科学家表示,他们研究的是承担大量分子功能的蛋白质,而其中一半,“我们甚至不知道是怎么运作的”。

Anthropic也昭示其野心,他们想让 Claude 扮演的是帮科学家做判断的研究者,而不是查文献、写代码的工具。

对一家以AI模型为核心产品的公司来说,把最多资源投向一个非核心业务方向,本身就是一种态度。

今年四月,A nthropic靠一笔四亿美元的股权收购杀入AI制药,被收购方Coefficient Bio是一家成立八个月、员工不足十人的小型AI制药初创。

9月16日,诺和诺德宣布和Anthropic达成一项深度合作,用AI加快药物研发。

目前,Anthropic已经和BMS达成深度合作,阿斯利康、Genmab、Veeva、Flatiron Health等公司也在试点中。

Anthropic反复强调的核心定位,药物研发的基础设施,公司明确表示不会开展临床试验。

模型层,Claude负责思考。软件层,Claude Science负责串联60多个科学数据库,深入科研流程。硬件层,MHS负责让Claude直接指挥机械臂、传感器、分析仪器,并对实验数据进行反馈和调整。


Kauderer-Abrams表示:"我们不与那些以将药物推向市场为生的制药和生物技术公司竞争"。

它瞄准的是传统药企认为盈利前景不佳的疾病领域,早期研究、罕见病、被行业老牌企业出于财务原因放弃的方向。

AI+生物科技这场牌局,桌子已经支起来了。

只是没人知道,坐在牌桌对面的,到底是一个新的合作伙伴,还是一个正在悄悄改写规则的人。

—The End—


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