华大领衔发布全球最大规模女性生殖道微生物基因组集，解码“女性健康密码”

阴道微生态是女性生殖道内的动态平衡系统，宿主和菌群之间、菌群与菌群之间保持着一种协调、平衡的状态，共同守护私密健康。这一系统一旦失衡，可能引发阴道炎、细菌性阴道病等妇科疾病。因此，维护阴道微生态平衡对于保障女性健康至关重要。

6月11日，武汉华大生命科学研究院联合北京协和医院等团队，成功构建了全球规模最大的女性生殖道微生物基因组集（GVMG）。这项跨越13,632份样本、涵盖65,055个微生物基因组的浩大工程，填补了亚洲人群相关数据的空白，为全球女性生殖健康研究领域点亮了“高清基因版图”，未来有望助力生殖道疾病机制解析、风险预警与精准干预等研究进展。相关成果在线发表于国际学术期刊《自然·遗传》（Nature Genetics）。

Nature Genetics官网截图

填补亚洲空白：

构建万名女性的微生物档案

长期以来，人类微生物组研究在人群和部位上深受局限，绝大多数研究以西方人群为对象，且高度集中于肠道。在女性生殖道菌群领域，长期缺乏覆盖亚洲人群的大规模、高质量基因组参考数据库。

为解决这一难题，华大依托“百万微生态”国际大科学计划，联合北京协和医院等团队，汇集了北京、深圳、苏州等多地超万份女性生殖道样本，并整合了来自美国、法国等11个国家的公共数据。

本次研究数据规模是此前全球最大人类阴道微生物参考基因组数据集（VMGC）的整整3倍，研究对象覆盖20多岁至85岁年龄段的女性，不仅涵盖大规模健康人群，还包括细菌性阴道病、HPV感染、宫颈炎、子宫肌瘤等疾病样本，为女性全生命周期健康研究构建了极为全面的“微生态档案”。

全球女性生殖道微生物基因组集GVMG的构建及分析

解码暗物质：

发现数千个全新微生物物种

研究团队首次以基因组分辨率系统解析了女性生殖道微生物的全貌，不仅能清楚知道有什么菌，还能精准区分不同菌株之间的基因组差异，并了解其对健康的影响。

研究团队利用宏基因组技术，对生殖道内的多界微生物进行深度解析：

· 共识别出890种原核基因组（889种细菌，1种古菌），其中13%为全新发现。传统上被视为单一物种的加德纳菌（Gardnerella vaginalis，一种与细菌性阴道病、HPV感染密切相关的关键菌),研究发现其具有极强的遗传异质性，在种水平上可细分为23个不同的物种；

· 鉴定出6,577种病毒，其中79%未被现有数据库收录。基于此，研究团队首次绘制了阴道病毒组与细菌互作的全球生态图谱，并识别出多个与女性健康相关的病毒标志物；

· 发现了白色念珠菌、光滑念珠菌等11种真菌的基因组，完善了多界微生物的认知版图。

在功能层面，研究团队系统解析了细菌性阴道病相关功能模块、抗生素耐药基因及毒性因子等特征。值得关注的是，常见的惰性乳杆菌（L. iners）中高达96%的菌株携带可能破坏黏膜屏障的基因，暗示其在特定条件下可能从“益生菌”转为“致病辅助菌”；而与它形成鲜明对比的是，卷曲乳杆菌（L. crispatus）则是保护黏液屏障的坚定“守护者”。此外，加德纳菌等致病菌虽都携带破坏工具，但各自的作用方式不同，展现了细菌性阴道病相关菌群内部的功能多样性。

源自全球女性阴道宏基因组的GVMG目录的原核生物基因组分布

跨国地理分化：

中美人群阴道菌群差异显著

研究发现，中美人群阴道菌群在菌株水平上存在显著差异。其中，卷曲乳杆菌（L. crispatus）基因组高度保守、功能稳定，受地理影响相对较小；而惰性乳杆菌（L. iners）则呈现较大的地理变异，更易受人群或环境背景影响。

此外，与细菌性阴道病及早产密切相关的细菌BVAB1，在美国人群中的检出率显著高于中国人群，且美源菌株在毒素产生、粘附与生存策略等方面表现出更强的致病潜力。这一发现提示，不同人群的疾病机制可能存在差异，未来的临床诊疗需考虑人群特异性。

宿主基因-微生物互作：

揭示遗传背景的决定性影响

本研究最令人瞩目的突破，在于首次将宿主基因型与生殖道微生物组进行了超大规模的深度整合分析（M-GWAS）。通过高分辨率关联分析，研究鉴定出7个与阴道菌群显著关联的遗传位点。其中，OPRK1基因可影响潜在致病菌解脲支原体的定植能力，这一发现为理解“为何不同女性对妇科疾病易感程度存在差异”提供了全新的遗传学视角。

通过宏基因组-全基因组关联分析识别的宿主遗传与阴道微生物组的关联

末位通讯作者、武汉华大生命科学研究院副研究员陈晨博士表示，“本次研究构建了目前全球最全面的阴道微生物组数据库，其具有完整的生命周期覆盖和广泛的地理多样性。该数据库不仅填补了亚洲人群的关键研究空白，还为全球阴道微生物组研究和深入解析微生物与宿主的相互作用奠定了重要基础。相信它将成为未来阴道微生物组研究的宝贵资源，进一步加深我们对这一领域的理解和认识。”

依托深厚的科研积累，华大持续推动前沿微生态研究成果向民生健康产品转化，让科学发现真正惠及大众。基于此前相关领域的科研沉淀，华大营养已成功筛选出3株自主研发的菌株——卷曲乳杆菌LG55、格氏乳杆菌TM13、鼠李糖乳杆菌OF44，并将其应用于旗下优美达“密蜜”益生菌系列产品，以精准配方守护中国女性私密健康。未来，华大营养团队还将依托本项研究新成果，持续开发更适配国人的微生态健康方案。

武汉华大生命科学研究院揭著业博士、梁卫婷博士、丁秋霞博士、刘小敏博士、原苏州高新区妇幼保健计划生育服务中心张韵红主任医师、北京协和医院陈娜副主任医师、武汉倍森生物科技有限公司的李胜辉为论文共同第一作者。武汉华大生命科学研究院陈晨博士、北京协和医院朱兰院士、武汉华大生命科学研究院郝梨岚博士、张涛博士为论文共同通讯作者。本研究严格遵循相关伦理规范。

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