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认知神经科学前沿文献分享
基本信息
Communications Biology 刊讯 | 2026年6月最新一期,共收录 100 篇。其中有中国机构或国人单位参与发表的文献 37 篇。(为控制单篇篇幅,本篇为第一期)
1. 挫折通过双人互动中的动态人际神经同步降低人际竞争
Title:Frustration reduces interpersonal competition through dynamic interpersonal neural synchronization in dyads
Type:研究文章
Time:2026-06-27
Abstracts:挫折会降低社会互动中的竞争意愿,但其背后的动态神经机制仍不清楚。研究采用功能性近红外光谱超扫描,在双人完成挫折任务后进行竞争任务时记录血流动力学活动。结果显示,挫折会逐步降低竞争意愿;相应地,中期阶段额极皮层的人际神经同步增强,后期阶段背外侧前额叶皮层的人际神经同步增强。额极皮层的人际神经同步介导了挫折对竞争表现的影响。研究还依据挫折任务表现划分角色差异,格兰杰因果分析显示双方存在双向影响,且领导者对跟随者的影响显著更强。这些发现表明,挫折通过增强中期额极皮层的人际神经同步来提高认知控制和执行功能,并通过增强后期背外侧前额叶皮层的人际神经同步来促进对他人意图的推断,从而动态降低竞争。本研究揭示了挫折状态下人际竞争过程中特异的神经模式。
Authors:Liu, Jingyue; Meng, Yujia; ...; Huang, Rui; Liu, Yingjie
作者单位:第一作者单位:中国河北省唐山市,华北理工大学心理与精神卫生学院,河北省心理健康与脑科学重点实验室;中国陕西省西安市,陕西师范大学现代教学技术教育部重点实验室也参与了本研究
Doi:10.1038/s42003-026-10573-6
2. 模块化巢穴结构影响蚁群活动周期同步
Title:Modular nest structure influences activity cycle synchronisation in ant colonies
Type:研究文章
Time:2026-06-27
Abstracts:从心跳到捕食者-猎物周期,周期性振荡广泛存在于生物系统中。然而,尽管振荡系统常呈模块化组织,不同模块中的周期如何产生并协调仍不清楚。研究以橡果蚁 Leptothorax acervorum 为对象,检验模块化巢穴结构如何影响短期活动周期。活动周期通常由巢穴内部自发的节律启动个体发起,并由中间的“传递”蚂蚁向外部区域传播。与单室巢穴相比,模块化双室巢穴使不同巢室间的活动部分解耦,从而降低全群体节律性。不过,在双室巢穴中,传递蚂蚁的移动速度高于单室巢穴,增强了活动传播,并部分恢复了巢室间协调。该研究不仅说明模块化结构如何塑造集体动力学,也揭示蚁群如何解决许多生物系统共同面临的基本问题:在物理分隔单元之间维持协调。
Authors:Richardson, Thomas O.; Rüegg, Matthias; ...; Keller, Laurent; Stroeymeyt, Nathalie
作者单位:第一作者单位:英国布里斯托,布里斯托大学生物科学学院
Doi:10.1038/s42003-026-10560-x
3. SMPD3通过自分泌与旁分泌双重作用抑制少突胶质细胞瘤生长
Title:SMPD3 suppresses oligodendroglioma growth via dual autocrine-paracrine roles
Type:研究文章
Time:2026-06-27
Abstracts:少突胶质细胞瘤是一类生长缓慢且生物学机制尚不清楚的肿瘤。研究发现,编码中性鞘磷脂酶2的 SMPD3 可通过细胞外囊泡生成和自分泌-旁分泌信号负向调控少突胶质细胞瘤进展。SMPD3 高表达与少突胶质细胞瘤和低级别胶质瘤患者更长的生存期相关。在患者来源的 BT54 和 BT88 细胞中敲低 SMPD3 会增加细胞增殖,增强 BT88 在脑类器官中的侵袭,并加速 BT88 肿瘤在小鼠异种移植和鸡胚绒毛尿囊膜实验中的生长。患者肿瘤显示异常的非肿瘤性胶质细胞增殖,以及肿瘤相关少突胶质细胞中富含核糖体的转录特征。与此一致,少突胶质细胞瘤来源且富含核糖体蛋白的细胞外囊泡可抑制星形胶质细胞增殖。药物抑制 nSMase2 或核糖体生物发生会在降低蛋白合成的同时增加少突胶质细胞瘤细胞增殖;阻断细胞外囊泡合成会增强核糖体抑制效应,而外源性细胞外囊泡可减弱这一效应。因此,SMPD3 介导的细胞外囊泡信号与核糖体应激共同调控少突胶质细胞瘤增殖,使 SMPD3 成为关键调控因子和潜在治疗靶点。
Authors:Saleh, Fermisk; Balakrishnan, Anjali; ...; Chan, Jennifer A.; Schuurmans, Carol
作者单位:第一作者单位:加拿大多伦多,Sunnybrook 研究所
Doi:10.1038/s42003-026-10556-7
4. SLC7A11缺乏通过诱导调节性T细胞不稳定和铁死亡加重系统性红斑狼疮
Title:SLC7A11 deficiency exacerbates systemic lupus erythematosus by inducing instability and ferroptosis in regulatory T cells
Type:研究文章
Time:2026-06-27
Abstracts:系统性红斑狼疮是一种严重威胁人类健康的自身免疫病。调节性 T 细胞对免疫稳态至关重要,系统性红斑狼疮中已发现调节性 T 细胞功能异常,但其机制仍很大程度上不清楚。研究发现,系统性红斑狼疮患者外周调节性 T 细胞数量及其中 SLC7A11 表达下降,且 SLC7A11 水平与疾病活动度呈负相关。在小鼠中,调节性 T 细胞特异性删除 SLC7A11 会损害其稳定性和分化,促进促炎表型,从而加重自身抗体产生和狼疮进展。机制上,轻度抑制 SLC7A11 可稳定 HIF-1α,增强糖酵解并增加调节性 T 细胞中的促炎细胞因子;严重抑制 SLC7A11 则导致过度脂质过氧化和铁死亡。总体而言,研究提示系统性红斑狼疮中 SLC7A11 表达降低的调节性 T 细胞可能发生不同程度的损伤:轻度缺乏驱动糖酵解和细胞不稳定,严重缺乏触发铁死亡。上调 SLC7A11 表达可能是治疗系统性红斑狼疮的有前景策略。
Authors:Ouyang, Lianlian; Chen, Fangqi; ...; Lu, Qianjin; Zhao, Ming
作者单位:第一作者单位:中国江苏省南京市,中国医学科学院北京协和医学院皮肤病医院、皮肤病研究所;中国湖南省长沙市,中南大学湘雅二医院皮肤科,湖南省医学表观基因组学重点实验室、中国江苏省南京市,中国医学科学院免疫介导皮肤病基础与转化研究重点实验室、中国江苏省南京市玄武区也参与了本研究
Doi:10.1038/s42003-026-10570-9
5. 脑机接口控制中受持续时间调节的人类神经群体动力学
Title:Duration-modulated neural population dynamics in humans during BMI controls
Type:研究文章
Time:2026-06-26
Abstracts:运动执行过程中,运动皮层常被描述为一个自主动力系统。在自主动力系统中,灵活生成运动依赖于重新配置初始条件,随后沿既定动力学展开。一个未解问题是,这些动力学是否支配脑机接口控制期间的运动皮层活动。研究考察了不同持续时间的脑机接口光标运动中的运动皮层活动,运动时长从数百毫秒到持续数秒不等,以覆盖现代脑机接口在不同精度水平下所需的运动持续时间范围。结果显示,相同方向但持续时间不同的运动共享运动皮层初始条件。长持续时间运动会使运动皮层活动维持在低速度稳态,直到达到运动目标。不同持续时间之间的运动皮层群体动力学差异可能归因于外部输入。研究结果强调了持续输入在运动皮层运动过程中的作用。
Authors:Yin, Fei; Guan, Charles; ...; Bari, Ausaf; Andersen, Richard A.
作者单位:第一作者单位:美国加利福尼亚州帕萨迪纳,加州理工学院生物学与生物工程学部
Doi:10.1038/s42003-026-10369-8
6. 野生啮齿动物适应性基因组变异的起源
Title:Origins of adaptive genomic variation in a wild rodent
Type:研究文章
Time:2026-06-26
Abstracts:种群历史是决定局地适应的重要因素,但相关研究仍不足。研究通过推断气候相关位点等位基因的地理来源来评估其作用。基于来自英国及欧洲大陆四个源种群的151只林䶄全基因组数据,这些源种群的祖源代表喀尔巴阡和西方避难所,研究评估了1074个候选位点中与气候适应相关 SNP 的来源。大多数适应性位点 SNP 属于广泛分布的多态性,在两个欧洲避难所和英国种群中共享。然而,与西方避难所特有等位基因贡献较小相比,规模更大且历史更久的喀尔巴阡避难所贡献了更多与气候适应相关的特有 SNP,且这些 SNP 与高温的正相关更强。总体而言,结果表明局地适应不仅受共享祖先变异影响,也受不同避难所独特进化遗产塑造。
Authors:da Cruz, Marcos O. R.; Marková, Silvia; ...; Kotlík, Petr; Lanier, Hayley C.
作者单位:第一作者单位:美国俄克拉荷马州诺曼,俄克拉荷马大学 Sam Noble 博物馆
Doi:10.1038/s42003-026-10511-6
7. 基因组演化和转座元件扩张揭示黄瓜枝孢菌的宿主相关基因组特征
Title:Genome evolution and transposable element expansion reveal host-associated genomic features in Cladosporium cucumerinum
Type:研究文章
Time:2026-06-26
Abstracts:病原体如何适应特定宿主仍是一个开放问题。研究考察了主要与葫芦科相关的病原菌黄瓜枝孢菌。对5个新测序的枝孢菌基因组和19个公开基因组进行比较基因组分析显示,黄瓜枝孢菌的分化发生在其黄瓜宿主谱系分化之后。研究观察到基因家族收缩,同时长末端重复反转录转座子发生谱系特异性扩张,并伴随基因组成变化,包括碳水化合物活性酶和次级代谢产物基因簇的变化。谱系特异性的 β-葡萄糖苷酶 CcBGL258 是致病所必需的,但在体外条件下并非营养生长所必需。转录组分析揭示了病原体和宿主在感染过程中基因表达的动态变化。总体而言,这些结果为研究黄瓜枝孢菌宿主相关特征提供了基因组框架,但研究也强调,观察到的若干关联仍属于相关性,需要进一步功能验证。
Authors:Lu, Xuanjun; Li, Qianxi; ...; Su, Zhenzhu; Lin, Fucheng
作者单位:第一作者单位:中国浙江省杭州市,浙江大学生物技术研究所,农产品质量安全全国重点实验室,浙江省农业微生物组学重点实验室;中国浙江省杭州市,浙江省农业科学院植物保护与微生物研究所,农产品质量安全全国重点实验室,浙江省农业微生物组学重点实验室,农业微生物组重点实验室(农业农村部)、中国江苏省南京市,南京农业大学生命科学学院、中国浙江省杭州市,湘湖实验室也参与了本研究
Doi:10.1038/s42003-026-10563-8
8. 葡萄糖富集通过体细胞组织中非自主性 DAF-2/胰岛素样受体信号加速秀丽隐杆线虫生殖衰老
Title:Glucose enrichment accelerates C. elegans reproductive aging via non-autonomous DAF-2/insulin-like receptor signaling in somatic tissues
Type:研究文章
Time:2026-06-25
Abstracts:生殖系统对饮食高度敏感,但营养过剩的长期生殖后果尚不明确。补充葡萄糖会缩短秀丽隐杆线虫寿命,研究发现它还会加速年龄相关的生殖衰退,表现为随年龄增长卵母细胞退化加重和生育力下降。20 mM 葡萄糖富集仍会缩短胰岛素样信号降低的 daf-2(e1370) 突变体寿命,但出乎意料的是,研究未检测到其对这些突变体生殖衰老表型的不利影响。通过生长素诱导的组织选择性降解,研究表明秀丽隐杆线虫肠道和体壁肌肉中的 DAF-2/胰岛素样受体信号,是葡萄糖富集损害老年线虫生殖功能所必需的;在任一组织中降解 DAF-2 均可保护线虫免受葡萄糖诱导的生殖衰老。研究还发现,在葡萄糖富集条件下,通过 RNAi 抑制 lipl-4 脂肪酶并破坏脂质稳态,可损害 daf-2(e1370) 的生殖功能。因此,代谢活跃体细胞组织中的胰岛素样信号可能是连接营养过剩与生殖衰老的关键环节。
Authors:Athar, Faria; Houston, Emma J.; ...; Centeno Duque, Manuel; Templeman, Nicole M.
作者单位:第一作者单位:加拿大维多利亚,维多利亚大学生物系
Doi:10.1038/s42003-026-10564-7
9. 土拉弗朗西斯菌 T6SS 效应蛋白 PdpC 的结构及其在胞内生活方式中的潜在作用
Title:Structure and potential role of T6SS effector PdpC in Francisella tularensis intracellular lifestyle
Type:研究文章
Time:2026-06-25
Abstracts:土拉弗朗西斯菌是一种革兰阴性兼性胞内病原体,可引起常致命的土拉菌病。其弗朗西斯菌致病岛编码的 VI 型分泌系统对毒力至关重要,但 T6SS 效应蛋白如何促进胞内复制仍不清楚。研究报道了 T6SS 效应蛋白 PdpC 的结构,揭示了一种无可识别同源蛋白的新型蛋白折叠。该结构类似海马,由五个结构域组成:N 端结构域、中央主体结构域、楔形结构域、C 端尾部和一个未建模的“口部”结构域。生化分析显示,PdpC 可结合宿主磷脂,尤其是磷脂酰肌醇-3-磷酸,并与另一种由致病岛编码的蛋白 PdpE 相互作用。结构指导的功能研究表明,仅中央主体结构域就足以介导这些相互作用,而 PdpE 通过非 T6SS 依赖途径分泌。这些发现解释了这一精巧效应蛋白组合如何促进吞噬体逃逸并建立感染:PdpC 由 T6SS 递送至富含 PI(3)P 的早期吞噬体膜并破坏吞噬体以逃逸,随后与 PdpE 协同促进弗朗西斯菌在胞质内复制。该研究将 PdpC 从孤立的毒力因子转化为弗朗西斯菌胞内生活方式核心处可研究的分子开关,并提示其可能成为抗土拉菌病治疗靶点。
Authors:Liu, Xiaoyu; Clemens, Daniel L.; ...; Horwitz, Marcus A.; Zhou, Z. Hong
作者单位:第一作者单位:中国湖北省武汉市,华中师范大学生命科学学院;中国湖北省武汉市,武汉大学生命科学学院,病毒学与生物安全全国重点实验室,泰康生命医学中心也参与了本研究
Doi:10.1038/s42003-026-10543-y
10. 多变量脑-行为关联的可重复性取决于临床特征
Title:Replicability of multivariate brain-behaviour associations depends on clinical profile
Type:研究文章
Time:2026-06-25
Abstracts:近期研究表明,多变量脑-行为分析需要数千名个体才能获得稳定可重复的结果。不过,也有人认为,如果针对特定亚群,较小样本量可能已经足够。研究使用 UK Biobank 数据集中的40514名参与者,考察样本量和队列组成如何影响典型相关分析结果的可重复性。研究将典型相关分析应用于弥散加权磁共振成像表型和认知评估测试分数,并根据临床特征定义了四个参与者队列。结果发现,在所有队列中,大约500的样本量即可获得可重复的典型相关和变量载荷。最具针对性的队列,即有精神活性物质使用史的个体,需要少得多的样本即可达到与其他队列相近或更高的相关性。研究结果支持这样一种观点:来自目标队列的中等样本量足以获得可重复的脑-行为关联。
Authors:Wang, Michelle; McPherson, Brent C.; ...; Greenwood, Celia M. T.; Poline, Jean-Baptiste
作者单位:第一作者单位:加拿大蒙特利尔,麦吉尔大学 The Neuro(蒙特利尔神经病学研究所-医院)McConnell 脑成像中心
Doi:10.1038/s42003-026-10364-z
11. 鲁索替尼通过抑制 CaMKII-γ 逆转多发性骨髓瘤对硼替佐米的耐药性
Title:Ruxolitinib inhibits CaMKII-γ to reverse bortezomib resistance in multiple myeloma
Type:研究文章
Time:2026-06-25
Abstracts:多发性骨髓瘤是第二常见的血液系统恶性肿瘤,发病率上升且发病年龄趋早。尽管蛋白酶体抑制剂等治疗策略有效,几乎所有患者最终都会产生耐药,因此亟需发现新的药物靶点和治疗方法。研究发现,钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶 II γ(CaMKII-γ)通过 AMPK-ULK1-自噬轴调控硼替佐米耐药性多发性骨髓瘤。高通量筛选鉴定出鲁索替尼是选择性 CaMKII-γ 抑制剂,可在硼替佐米耐药细胞系和雌性 BALB/c 裸鼠模型中逆转耐药,其效果与遗传性敲除 CaMKII-γ 相当。该研究阐明了 CaMKII-γ 及其选择性抑制剂鲁索替尼在硼替佐米耐药多发性骨髓瘤中的作用,为耐药逆转提供了潜在治疗策略。
Authors:Liang, Ruqi; Liu, Hong; ...; Zhang, Chaofeng; Wang, Mingdi
作者单位:第一作者单位:中国山西太原,太原理工大学,化学与化工学院;中国山西太原,山西省功能蛋白重点实验室、中国山西太原,太原理工大学,人工智能学院、中国山西太原,太原理工大学,纺织工程学院、中国北京,北京大学首钢医院,血液科也参与了本研究
Doi:10.1038/s42003-026-10553-w
12. 多尺度结构连接组本征模约束人脑功能动态
Title:Multiscale structural connectome eigenmodes constrain human brain functional dynamics
Type:研究文章
Time:2026-06-25
Abstracts:人脑是一个跨多尺度结构组织的复杂网络。多尺度结构架构源于复杂的生物学机制,并为功能交互提供解剖基础,但其对功能活动的约束程度仍不清楚。研究整合白质纤维追踪、微结构相似性和皮质间空间邻近性,构建了体内多尺度结构连接组。结果显示,多尺度结构连接组本征模比传统结构连接近似方法更能捕捉自发和任务诱发的功能活动。进一步的结构-功能解耦分析揭示了一条从耦合的单模态感觉皮层到解耦的跨模态联合皮层的组织轴,并重现了微结构和宏观功能层级。这些解耦模式在空间上与阿片类神经递质受体和线粒体琥珀酸脱氢酶相一致,并与富集于突触结构和信号调控的转录组特征共定位。研究表明,多尺度结构布线在塑造脑功能动态中具有关键作用,并为结构-功能关系提供了新的神经生物学认识。
Authors:Xia, Jie; Yang, Siqi; ...; Zeng, Fang; Liao, Wei
作者单位:第一作者单位:中国四川成都,成都中医药大学,针灸推拿学院;中国四川成都,成都中医药大学,针灸与脑科学研究中心、中国四川成都,教育部针灸防治老年病重点实验室(成都中医药大学)、中国四川成都,电子科技大学生命科学与技术学院,成都脑科学研究院临床医院、中国四川成都,成都信息工程大学,网络空间安全学院也参与了本研究
Doi:10.1038/s42003-026-10558-5
13. 三倍体在浮萍 Lemna minor 复合群中较为突出
Title:Triploidy is prominent in the duckweed Lemna minor complex
Type:研究文章
Time:2026-06-25
Abstracts:浮萍科植物是水生单子叶植物,被认为是地球上最小且生长最快的开花植物。许多物种因结构简化而在形态上难以区分,但分子证据提示,外观相似的克隆可能属于不同物种或杂交体。研究采用基因组学、分子生物学和细胞遗传学等多种方法,分析了 58 个推定为 Lemna minor 的克隆。结果显示,“Lemna minor 复合群”存在广泛的基因组可塑性,包括二倍体和三倍体 L. minor 克隆、异源二倍体和异源三倍体种间杂交体,以及一个新的非洲分支 L. minor 谱系。三倍体在自然界较为常见,在该集合中先前被鉴定为 L. minor 的克隆中占 33%,并在最佳条件下与更好的生长指标相关。对于以无性繁殖为主的浮萍而言,三倍体障碍并不构成限制,因此三倍体后代可能在许多野生 Lemna 群体中成为多数。研究表明,多倍化和杂交可能在这些主要无性繁殖植物的种群动态和环境变化下的进化中发挥重要作用。
Authors:Michael, Todd P.; Hoang, Phuong T. N.; ...; Martienssen, Robert A.; Lam, Eric
作者单位:第一作者单位:美国拉霍亚,Salk 生物研究所,植物分子与细胞实验室
Doi:10.1038/s42003-026-10294-w
14. 昼夜节律性转录紊乱参与放疗诱导的唾液腺功能减退
Title:Perturbation of the circadian rhythmic transcription contributes to radiotherapy-induced salivary gland hypofunction
Type:研究文章
Time:2026-06-25
Abstracts:头颈部癌症患者放疗后常出现唾液腺功能减退,导致口干症。既往研究提示唾液腺功能受昼夜节律钟调控,但这种调控的范围和程度尚未明确。研究分析了小鼠颌下腺基因表达的昼夜波动,发现约 6% 的转录组呈节律性表达。进一步分析关键昼夜节律转录因子 BMAL1、NR1D1(REV-ERBA)和 DBP 的调控作用,揭示了广泛的潜在下游靶基因。照射会通过与 p53 激活和活性氧增加相关的过程破坏昼夜节律性转录。使用川陈皮素和 SR1078 等化学药物调节昼夜节律钟,可减轻损伤并改善唾液分泌。研究提出,放疗后的唾液腺功能减退涉及昼夜节律性转录紊乱,而改善昼夜节律的化学药物可部分挽救这一功能损害。
Authors:Song, Shi-Ting; Yang, Kai-Bin; ...; Huang, Zhen; Yue, Zhi-Cao
作者单位:第一作者单位:中国广东深圳,深圳大学医学部,国际癌症中心、广东省基因组不稳定性与疾病重点实验室,细胞生物学与医学遗传学系;中国广东佛山,佛山市第一人民医院癌症中心,放射肿瘤科、中国福建福州,福建中医药大学,创新转化中心也参与了本研究
Doi:10.1038/s42003-026-10551-y
15. 结构指导开发有效作用于苯丙酮尿症小鼠模型的强效人 B0AT1 抑制剂
Title:Structure-guided development of a potent human B0AT1 inhibitor effective in a mouse model of phenylketonuria
Type:研究文章
Time:2026-06-25
Abstracts:B0AT1(SLC6A19)是一种中性氨基酸转运体,介导包括苯丙氨酸在内的氨基酸肠道吸收和肾脏重吸收。抑制 B0AT1 可增强苯丙氨酸排泄,为苯丙酮尿症治疗提供策略。研究利用冷冻电镜解析了人 B0AT1 外向开放和内向开放状态结构,发现一个距底物结合位点约 17 Å、存在于外向开放构象中的别构口袋。基于结构的抑制剂设计靶向该口袋,获得一种强效 B0AT1 抑制剂,可将转运体锁定在外向闭合状态并阻断转运。更高分辨率结构揭示了结合位点的详细相互作用,包括水介导的配位以及 Leu52 周围的构象变化。该抑制剂对人和小鼠 B0AT1 均表现出亚微摩尔级 IC50,口服给药可增加苯丙酮尿症模型小鼠尿中苯丙氨酸并降低血浆苯丙氨酸水平。研究为 B0AT1 别构抑制提供了结构认识,并为靶向 SLC6 家族转运体动态别构位点的抑制剂理性优化奠定了框架。
Authors:Imazu, Takuya; Akashi, Tomoya; ...; Nureki, Osamu; Miyaguchi, Ikuko
作者单位:第一作者单位:日本横滨,Mitsubishi Tanabe Pharma Co., Ltd.,Sohyaku 创新研究部,神经科学单元
Doi:10.1038/s42003-026-10535-y
16. 高分辨率三维染色质图谱揭示 PTEN 增强子枢纽通过侧翼锚点连接至启动子
Title:High-resolution 3D chromatin maps reveal PTEN enhancer hubs bridged to the promoter through flanking anchors
Type:研究文章
Time:2026-06-25
Abstracts:理解肿瘤抑制基因座的顺式调控架构,对阐明癌症和遗传综合征中的基因失调机制至关重要。尽管 PTEN 在多种癌症和 PTEN 错构瘤肿瘤综合征中具有核心作用,其调控图景仍大多未被解析。研究利用高分辨率 Tiled-C 和多组学分析,在 11 个人类细胞系中绘制了 PTEN 拓扑关联结构域周围 3 Mb 区域,其中包括两个患者来源模型。研究识别出 7 个染色质枢纽,锚定 11 个增强子;CRISPR 干扰这些增强子可显著降低 PTEN 表达。在这些枢纽中,大多数增强子更倾向于彼此相互作用,而非直接与 PTEN 启动子相互作用,形成空间组织化的增强子网络。值得注意的是,增强子并不直接接触启动子,而是通过富集 REX 元件的相关侧翼染色质锚点被拉近,从而桥接远端调控元件实现基因调控。最后,结构变异可破坏 TAD,而 PTEN 突变本身仅轻微增强 TAD 内部联系,并不改变结构。该研究提供了首个 PTEN 增强子枢纽高分辨率图谱,揭示了增强子协作和长程基因调控的新原则,并界定了其破坏可能导致 PTEN 错构瘤肿瘤综合征和 PTEN 驱动肿瘤发生的候选区域。
Authors:Matis, Thibaut; Darbo, Elodie; ...; Longy, Michel; Sévenet, Nicolas
作者单位:第一作者单位:法国波尔多,波尔多大学,INSERM,BRIC,U 1312
Doi:10.1038/s42003-026-10533-0
17. 笑声的节律和时序表明人类发声可塑性处于人科连续谱中
Title:Rhythm and timing in laughter reveal that human vocal plasticity falls on a hominid continuum
Type:研究文章
Time:2026-06-25
Abstracts:笑声是人类重要且普遍的非语言发声表达形式,并为现存所有大型类人猿所共有,因此可作为追溯最终促成语言的发声控制演化的有价值线索。然而,人们对笑声定义性特征之一节律的演化了解仍然很少。研究比较分析了所有现存大型类人猿,包括猩猩、大猩猩、倭黑猩猩、黑猩猩和人类的笑声,发现它们的末代共同祖先的笑声已经具有等时性;在人科演化过程中,笑声变得更快、变异更大,并且越来越受情境影响。笑声节律的演化显示发声节律可塑性逐步增强,人类沿着整体轨迹发展出更强的发声控制能力。
Authors:De Gregorio, Chiara; Davila-Ross, Marina; Lameira, Adriano R.
作者单位:第一作者单位:英国考文垂,华威大学心理学系,ApeTank
Doi:10.1038/s42003-026-10499-z
18. Kv1.3 与 Nedd4-2 E3 泛素连接酶之间的衔接蛋白介导相互作用
Title:Adaptor-mediated interaction between Kv1.3 and Nedd4-2 E3 ubiquitin ligase
Type:研究文章
Time:2026-06-24
Abstracts:电压门控钾通道 Kv1.3 对免疫反应至关重要。在促炎刺激下,Kv1.3 上调,增强 Ca²⁺ 信号和白细胞激活。为防止淋巴细胞活性持续过久,过量 Kv1.3 必须从质膜移除,因为其水平升高与慢性炎症相关。E3 泛素连接酶 Nedd4-2 是重要的负调控因子,可通过泛素化和溶酶体靶向促进 Kv1.3 降解。由于 Kv1.3 缺乏 Nedd4-2 结合所需的典型 PY 基序,因此需要衔接蛋白。研究发现,Ndfip1 和特定 14-3-3 蛋白促进 Nedd4-2 与 Kv1.3 的相互作用。PKC 激活后,Kv1.3 与 Nedd4-2 在膜附近发生快速而短暂的结合,启动泛素化、囊泡内化和溶酶体降解。该研究识别出介导 Kv1.3 调控的 Nedd4-2 衔接蛋白,强调 Ndfip1 是关键因子,而单个 14-3-3 亚型的作用仍需进一步阐明。
Authors:Estadella, Irene; Benavente-Garcia, Anna; ...; Robles-Prieto, Judith; Felipe, Antonio
作者单位:第一作者单位:西班牙巴塞罗那,巴塞罗那大学,生物医学研究所(IBUB),生物化学与分子生物医学系,分子生理学实验室
Doi:10.1038/s42003-026-10557-6
19. 疼痛共情中额下回对运动皮层兴奋性的自上而下影响
Title:Top-down influence of the inferior frontal gyrus on motor cortex excitability during pain empathy
Type:研究文章
Time:2026-06-24
Abstracts:对疼痛的共情可降低观察者运动系统活动,但塑造这一反应的神经过程仍不清楚。研究发现,以第一人称视角观察他人疼痛会降低皮质脊髓兴奋性并提高感知疼痛强度,而第三人称视角不会产生这种效应。当伤害性事件作用于非生物物体时,这种运动抑制消失。通过单脉冲、成对脉冲和双位点经颅磁刺激,研究未发现局部运动皮层抑制或易化回路出现可检测变化,但观察到额下回与初级运动皮层之间的连接指数发生疼痛特异性下降。该效应与感知疼痛强度和运动抑制共同变化,并且相对于 Vertex 对照条件具有位点特异性。贝叶斯网络建模进一步提示,感知疼痛强度可预测不愉快感和运动兴奋性。总体而言,这些发现提示疼痛评价可能与疼痛共情中的额叶-运动系统相互作用相关。
Authors:Zhang, Pengju; Lin, Yitong; ...; Tan, Xiaoying; Zhang, Jian
作者单位:第一作者单位:中国上海,上海体育大学,心理学院;中国安徽合肥,安徽中医药大学,护理学院、中国河南洛阳,河南科技大学,体育学院、中国澳门特别行政区,澳门理工大学,健康科学及体育学院也参与了本研究
Doi:10.1038/s42003-026-10529-w
20. 元意识、走神以及自动外部和内部注意取向的控制
Title:Meta-awareness, mind-wandering, and the control of automatic external and internal orientations of attention
Type:研究文章
Time:2026-06-24
Abstracts:认知的“默认”模式涉及对内部体验的模拟。然而在某些情境下,外部焦点也可能足够吸引注意,从而成为默认模式。为考察这些取向之间的关系,研究记录了 39 名参与者观看自然istic 视频片段时的 fMRI 活动,每个片段连续重复播放四次。当参与者被要求将注意力外向集中于视频时,走神多发生在最后一次重复以及吸引力较低的视频片段中;当被要求将注意力内向集中于呼吸时,走神多发生在第一次重复以及更有吸引力的视频片段中。被试间相关、被试内相关和广义线性模型显示,在两种条件下,从自动注意转向受控注意时均涉及相似的额顶网络,说明内部和外部加工的重叠程度高于以往假设。研究认为,注意的自动牵引是内部还是外部,其干扰源是内部还是外部,取决于情境。自动注意取向源于个体与环境之间的相互作用;理解走神需要同时考虑外部刺激和内部思维的吸引力。
Authors:Christian, Isaac R.; Nastase, Samuel A.; Kim, Lauren K.; Graziano, Michael S. A.
作者单位:第一作者单位:美国普林斯顿,普林斯顿大学,心理学系
Doi:10.1038/s42003-026-10410-w
21. 牙周病原体牙龈卟啉单胞菌天然组装 Mfa V 型菌毛的冷冻电镜结构
Title:Cryo-EM structure of the native assembled Mfa type V pilus from the periodontal pathogen Porphyromonas gingivalis
Type:研究文章
Time:2026-06-24
Abstracts:牙龈卟啉单胞菌是导致牙周病的主要病原体。其细胞具有 Fim 菌毛和 Mfa 菌毛两类 V 型菌毛,二者在定植、生物膜形成和致病性中发挥关键作用。Fim 菌毛的功能性聚合结构已被解析,但 Mfa 菌毛的结构和组装机制仍不清楚。本研究利用冷冻电镜以 3.0 Å 分辨率解析了聚合重组 Mfa1 主干菌毛蛋白的结构。Mfa1 丝状体的原子模型显示,Mfa1 菌毛蛋白通过蛋白酶介导的链交换实现聚合,并在金属结合口袋中保留 Ca2+ 离子,该离子可调节人类细胞对 Mfa 菌毛的免疫识别。研究还阐明了 Mfa 菌毛上链球菌结合区域的三维构型。结果进一步支持蛋白酶介导的链交换是 V 型菌毛普遍组装机制的证据。聚合 Mfa 菌毛结构代表其在细胞表面的功能状态,为开发治疗牙周病及牙龈卟啉单胞菌相关系统性疾病的抗菌药物提供了靶点。生化和计算分析还界定了 Mfa1 与 SspB 的相互作用。
Authors:Shibata, Satoshi; Matsunami, Hideyuki; ...; Shoji, Mikio; Wolf, Matthias
作者单位:第一作者单位:日本冲绳,冲绳科学技术大学院大学,分子冷冻电子显微镜单元
Doi:10.1038/s42003-026-10515-2
22. 中枢和肠神经系统突触及突触小泡的蛋白质组图谱
Title:Proteomic maps of synapses and synaptic vesicles across the central and enteric nervous systems
Type:研究文章
Time:2026-06-24
Abstracts:中枢神经系统突触蛋白质组已得到广泛表征,但外周神经系统中的组成仍未知。作为“第二大脑”的肠神经系统亟需明确其精细蛋白质组景观,并与中枢神经系统的分子异质性进行系统比较。为此,研究开发了整合亚细胞细胞器分离和 PulseDIA 蛋白质组学的简化流程,在中枢和肠神经系统中鉴定出 13,534 个突触蛋白,其中肠神经系统为 8,807 个;同时界定了中枢神经系统 776 个和肠神经系统 1,148 个突触小泡驻留蛋白。比较蛋白质组学显示,两类神经系统存在分子特征差异,但维持保守的功能组织,呈现“分化-趋同”关系。小鼠能量摄入限制会诱导肠神经系统蛋白质组发生广泛重塑。药理学抑制 FGFR1 激酶活性可在不依赖能量底物利用的情况下抑制产热,提示 FGFR1 可能参与肠神经系统介导的能量代谢调控。本研究为神经生物学和神经疾病研究提供了资源,并阐明了中枢和肠神经系统蛋白质组的差异与趋同。
Authors:Liu, Shiqi; Huang, Qiwang; ...; Wang, Jian; Jia, Chenxi
作者单位:第一作者单位:中国北京,北京生命组学研究所,北京蛋白质组研究中心,蛋白质组学国家重点实验室,国家蛋白质科学中心(北京);中国安徽合肥,安徽医科大学,基础医学院、中国河北保定,河北大学,生命科学学院、中国天津,天津大学,药物科学与技术学院也参与了本研究
Doi:10.1038/s42003-026-10190-3
23. 单细胞长读长测序解析嗅觉感觉神经元分化与多样性
Title:Single-cell long-read profiling of olfactory sensory neuron differentiation and diversity
Type:研究文章
Time:2026-06-24
Abstracts:嗅觉感觉神经元由高度异质的亚型群体组成。转录后调控是促进神经元多样性的重要机制,其中转录本异构体异质性是关键组成部分。因此,全面描绘嗅觉感觉神经元中的转录本异构体,对于理解其多样性的分子机制至关重要。研究整合单细胞长读长测序和常规 3' RNA 测序,发现这些神经元具有广泛的异构体多样性。研究鉴定出与发育阶段和空间投射模式相关的普遍 UTR 重塑和异构体转换,为嗅觉感觉神经元多样性的关键调控机制提供了有力证据。此外,研究观察到单个嗅觉感觉神经元中同一嗅觉受体基因的多个异构体共同表达,其中部分预计可编码完整跨膜结构域。这些数据为研究特定异构体如何影响嗅觉感觉神经元身份、轴突靶向以及单一嗅觉受体表达维持提供了资源和框架。
Authors:Xu, Yicong; Yang, Jiawen; ...; Ma, Qing; Xu, Jin
作者单位:第一作者单位:中国广东广州,中山大学,生命科学学院,生物防治国家重点实验室,进化合成生物学创新中心;中国广东深圳,中国科学院深圳先进技术研究院,深圳合成生物学研究所,定量合成生物学国家重点实验室,广东省合成基因组学重点实验室,深圳市合成基因组学重点实验室也参与了本研究
Doi:10.1038/s42003-026-10544-x
24. TPH1 依赖性母体低血清素血症对成年野生型小鼠后代的长期影响
Title:TPH1-dependent maternal hyposerotonemia: long-term effects on adult wild-type mouse offspring
Type:研究文章
Time:2026-06-24
Abstracts:许多情绪和行为障碍源于遗传与环境相互作用造成的发育异常。母体色氨酸羟化酶 1(TPH-1)依赖性血清素(5-HT)耗竭会改变胚胎脑发育,但其对成年后代的长期影响此前尚未研究。本研究显示,低血清素 Tph1+/- 母鼠所生的成年野生型雄性后代约有 60% 血清素缺乏,相比野生型母鼠后代表现出活动过度、自我照护受损和焦虑增加。与此同时,其中脑和脑干中去甲肾上腺素水平及多巴胺周转显著降低,而单胺能细胞密度未受影响。后代额叶皮层中,母体低血清素状态导致多巴胺、去甲肾上腺素和血清素水平显著下降,并伴随转录组改变,尤其涉及单胺能系统信号、突触功能与可塑性、甲基化过程和髓鞘形成。胼胝体厚度降低也显示髓鞘形成受损。因此,母体低血清素血症足以影响成年野生型后代的表型。妊娠期 TPH-1 依赖性 5-HT 缺乏可能是后代神经发育障碍的风险因素。
Authors:Saurini, Françoise; Jaliffa, Carolina; ...; Berrard, Sylvie; Vitalis, Tania
作者单位:第一作者单位:法国巴黎,巴黎西岱大学,Inserm U1141,NeuroDiderot
Doi:10.1038/s42003-026-10549-6
25. ScQCenrich 实现单细胞 RNA 测序的多指标质量控制
Title:ScQCenrich enables multi-metric quality control for single-cell RNA sequencing
Type:研究文章
Time:2026-06-24
Abstracts:单细胞 RNA 测序容易受到组织解离应激、部分裂解以及核质失衡影响,但质量控制仍常依赖线粒体 RNA、基因数和 UMI 的固定阈值。研究提出了 ScQCenrich,这是一种面向细胞识别后全细胞 scRNA-seq 的可解释多指标质量控制框架,整合经典指标、内含子比例、MALAT1 富集、解离应激特征以及可选的剪接感知信息。在小鼠脑、小鼠心脏和肺癌数据集中,ScQCenrich 相比传统方法和基于模型的对照减少了过度过滤,同时保留了具有一致生物学特征的神经元、红系细胞、心肌细胞和恶性细胞群体。在高质量外周血单个核细胞数据中,该方法仍保持保守。自动报告可将质控判定与簇水平指标、标志基因和功能富集联系起来。因此,ScQCenrich 为全细胞单细胞 RNA 测序分析中的质量控制决策提供了透明且可重复的框架。
Authors:Liu, Yuanyuan; Yang, Cheng; ...; Wu, Lihua; Xie, Xiufeng
作者单位:第一作者单位:中国北京,中国人民解放军总医院第七医学中心;中国北京,解放军医学院、中国北京,Reahealth Inc、中国北京,军事医学科学院,生物信息学中心、中国重庆,陆军军医大学西南医院,皮肤科、中国北京,中国人民解放军总医院第七医学中心,生物治疗中心也参与了本研究
Doi:10.1038/s42003-026-10382-x
26. 甲状腺激素、胰岛素和甘油脂通路的适应性进化改善了高纬度欧亚人群的能量代谢
Title:Adaptive evolution at thyroid hormone, insulin and glycerolipid pathways improved energy metabolism in high-latitude Eurasian populations
Type:研究文章
Time:2026-06-23
Abstracts:高纬度人群是研究人类适应寒冷气候的遗传基础的重要案例。然而,传统自然选择模型只能识别其中有限的一部分。为克服这一问题,研究整合多种推断方法,尝试定位同时具有选择信号和功能关联的基因组合,这些组合可能协同调控某一生物性状,符合多基因适应的预期。研究分析了西伯利亚东北部雅库特人和俄罗斯人的基因组,发现参与寒冷暴露时受调控功能的基因发生适应性进化,包括甲状腺激素/胰岛素信号相关基因 THRB、RCAN2、INSR、NFKB1,棕色脂肪组织分化相关基因 ERBB4,以及甘油脂代谢相关基因 GPAT3。这些位点的协同变化可能支持更强的产热能力和胰岛素反应性,并部分受到尼安德特人基因渗入影响,为欧亚祖先得以定居寒冷环境的复杂适应提供了提示性线索。
Authors:Ferraretti, Giulia; Alberti, Marta; ...; Sarno, Stefania; Sazzini, Marco
作者单位:第一作者单位:意大利博洛尼亚,博洛尼亚大学,生物、地质与环境科学系,分子人类学实验室与基因组生物学中心
Doi:10.1038/s42003-026-10540-1
27. 离子通道和转运体的胚层特异性相互作用控制热带爪蟾膜电位与左右模式形成
Title:Germ layer-specific interaction of ion channels and transporters controls membrane potential and left-right patterning in Xenopus tropicalis
Type:研究文章
Time:2026-06-23
Abstracts:越来越多证据表明,离子通道和转运体对正常胚胎发育至关重要,它们是建立所有细胞膜电位的基础。然而,胚胎是否存在胚层特异性的区域电活动差异,并由此参与局部细胞命运决定,目前仍不明确。研究通过操纵离子浓度并使用多种抑制剂,证明不同离子通道和转运体在热带爪蟾胚胎特定胚层中以差异方式决定膜电位。改变胚胎电学性质会引起局部细胞命运变化和左右模式异常,后者可能导致异位综合征和先天性心脏病等严重疾病。结果表明,早期胚胎细胞的电学性质具有区域特异性,并会影响局部细胞命运。
Authors:Tyan, Leonid; Kostiuk, Valentyna; ...; Zenisek, David; Khokha, Mustafa K.
作者单位:第一作者单位:美国纽黑文,耶鲁大学医学院,儿科与遗传学系,儿科基因组发现项目
Doi:10.1038/s42003-026-10039-9
28. 背内侧前额叶皮层将抽象规划与运动执行相连接
Title:Dorsomedial prefrontal cortex links abstract planning to motor execution
Type:研究文章
Time:2026-06-23
Abstracts:心理规划对于产生动作序列至关重要。尽管规划参与许多日常活动,但将已选计划映射为具体行动过程的神经认知机制仍不清楚。研究探讨了规划和执行是否通过抽象任务关系相连接,而这种关系不依赖动作实施中的具体知觉和运动细节。人类参与者在执行一项任务时接受功能磁共振成像,该任务要求编码并维持抽象表征,用于规划并随后应用这些表征执行动作序列。分析显示,背内侧前额叶皮层在规划阶段编码的表征会逐步从基于知觉输入的信息转向与抽象任务情境相关的信息。随后,这些抽象表征被用于在动作计划和执行之间进行转换,且不受具体知觉和运动细节影响,表明背内侧前额叶皮层能够构建并维持连接规划与行动的抽象表征桥梁。
Authors:Alejandro, Ricardo J.; Ikink, Iris; Foinikianaki, Emmanouela; Holroyd, Clay B.
作者单位:第一作者单位:比利时根特,根特大学,实验心理学系
Doi:10.1038/s42003-026-10513-4
29. 胰腺 α 细胞具有功能异质性,并受邻近内分泌细胞的性别依赖性调控
Title:Pancreatic α-cells are functionally heterogeneous and sex-dependently regulated by neighboring endocrine cells
Type:研究文章
Time:2026-06-23
Abstracts:葡萄糖和旁分泌信号对 α 细胞的调控,尤其是性别差异方面,仍了解不足。研究在 GluCre:GCaMP6f 小鼠胰腺切片中对胰岛进行成像,并额外加载红色 Ca2+ 指示剂,以精确分析 α 细胞及邻近 β、δ 细胞的 Ca2+ 动态。在葡萄糖梯度升高过程中(1.8-10.8 mM),α 细胞 Ca2+ 振荡具有异质性,与 β 细胞呈反相,并与 δ 细胞呈负相关。选择性抑制胰岛素受体以及生长抑素受体 2 型和 3 型后,多数 α 细胞转为高活性,并延缓葡萄糖梯度中 α 细胞活动下降和 β 细胞 Ca2+ 振荡启动。雌性 α 细胞对 SSTR2/3 抑制更敏感,而雄性 α 细胞对 InsR 阻断反应更强。在完全拮抗 SSTR2/3 和 InsR 的条件下,α 细胞 Ca2+ 振荡升高,但仍保持葡萄糖依赖性。研究认为,胰岛内协调可精细调节 α 细胞葡萄糖反应,性别特异性旁分泌信号可能塑造代谢疾病中的胰高血糖素谱。
Authors:Huang, Ya-Chi; Slak Rupnik, Marjan; Rutter, Guy A.
作者单位:第一作者单位:加拿大蒙特利尔,蒙特利尔大学及其附属医院中心研究中心(CRCHUM)
Doi:10.1038/s42003-026-10163-6
30. 基于 38 万余名参与者的大规模人血浆代谢物图谱
Title:A large-scale human plasma metabolite atlas from over 380,000 participants
Type:研究文章
Time:2026-06-23
Abstracts:大规模代谢组学可系统描绘循环小分子代谢物,并综合反映遗传、环境、生活方式和微生物因素对人类健康的影响,但关于代谢物与多种性状、疾病、共病、预测和因果关系之间联系的全面证据仍有限。研究分析了 212,751 名 UK Biobank 参与者中 251 种核磁共振衍生血浆代谢物,并在新发布数据波次中的 177,013 人中进行独立验证。通过多变量回归和严格 Bonferroni 校正,对 884 项健康相关性状、722 种现患疾病和 1,137 种新发疾病进行检验,鉴定出 67,505 个代谢物-性状关联、21,982 个代谢物-现患疾病关联和 41,214 个代谢物-新发疾病关联,复制率分别为 76.1%、83.3% 和 74.0%。这些关联最集中于内分泌、代谢和循环系统疾病。对疾病-代谢物谱进行无监督聚类后,研究发现现患疾病和新发疾病分别形成 10 个和 12 个疾病簇,这些簇跨越 ICD-10 章节但共享趋同的代谢组特征,为临床共病提供了代谢基础。基于代谢物的预测模型对短期结局的表现优于长期结局,肌酐是现患疾病模型中最常被选择的预测因子。双向孟德尔随机化鉴定出 61 个潜在的代谢物到疾病的因果效应,以及 558 个疾病驱动的代谢改变。本研究提供了系统验证的血浆代谢组图谱,将代谢物与人类性状和疾病相联系,并为共病、风险预测和潜在因果通路提供了见解。
Authors:Li, Zhirong; Miao, Yating; ...; Ma, Yanan; Zhang, Xinyao
作者单位:第一作者单位:中国吉林长春,吉林大学,公共卫生学院,社会医学与卫生事业管理学系;中国吉林长春,吉林大学,公共卫生学院,流行病学与卫生统计学系、中国辽宁沈阳,中国医科大学,公共卫生学院,卫生统计学与流行病学系,环境应激与慢性病防控教育部重点实验室、中国辽宁沈阳,中国医科大学,健康科学研究院,辽宁省肥胖与糖脂代谢相关疾病重点实验室也参与了本研究
Doi:10.1038/s42003-026-10505-4
31. 环境变化提高农业土壤中稀有微生物对生态系统功能的贡献
Title:Environmental change increases the contribution of rare microbial species to ecosystem functioning in agricultural soils
Type:研究文章
Time:2026-06-23
Abstracts:理解土壤微生物群落对环境变化的响应,以及它们在受扰动条件下对生态系统功能的贡献,具有基础性意义。然而,在环境变化下,稀有微生物和优势微生物在维持土壤功能中的相对作用仍不清楚,尤其是在农业生态系统中。本研究在中国东部50块农田采集土壤样品,考察包括细菌、真菌和原生生物在内的多营养级土壤生物中稀有与优势亚群落对气候变暖、干湿循环和养分富集的响应模式,并评估它们对生态系统多功能性的相对贡献。结果发现,与优势类群不同,稀有物种多样性在干湿循环下显著下降,而在养分添加后增加。此外,在所有处理下,优势物种的群落抗性均显著高于稀有物种。共现网络分析显示,环境变化会增强优势和稀有亚群落中的物种关联,其中稀有物种的变化更为明显。值得注意的是,稀有物种成为生态系统功能的主要驱动因素,且其贡献在环境变化下更加突出。总体而言,这些结果凸显了稀有物种在全球变化情景下支撑和增强农业生态系统功能中的关键作用。
Authors:Qi, Jiejun; Gao, Min; ...; Wang, Xinye; Chen, Chun
作者单位:第一作者单位:中国陕西杨凌,西北农林科技大学生命科学学院,作物抗逆与高效生产全国重点实验室,陕西省农业与环境微生物学重点实验室;中国贵州仁怀,茅台学院酿酒工程系也参与了本研究
Doi:10.1038/s42003-026-10489-1
32. 日本个体免疫细胞的单细胞图谱
Title:Single-cell catalogue of immune cells from Japanese individuals
Type:研究文章
Time:2026-06-23
Abstracts:健康个体之间免疫细胞的基因表达差异很大,并可能受到遗传背景、年龄及其他因素影响。然而,单细胞水平上免疫多样性的分子机制仍未得到充分理解。本研究构建了来自105名日本个体外周血的单细胞多组学数据集,重点分析细胞群体和基因表达水平随年龄发生的变化。在该数据集中,与年龄相关的群体变化在初始T细胞、记忆B细胞和CD56bright NK细胞中最为明显,这些细胞分别与相应细胞谱系的初始免疫反应相关。相反,单核细胞表现出显著的表观基因组变化,而且这些变化常常先于转录组变化出现,尤其是在免疫反应基因中。该数据集代表了单细胞研究中覆盖不足的日本人群,将为未来研究提供重要资源。
Authors:Kashima, Yukie; Makishima, Kenichi; ...; Sakata-Yanagimoto, Mamiko; Suzuki, Yutaka
作者单位:第一作者单位:日本千叶,东京大学新领域创成科学研究科计算生物学与医学科学系
Doi:10.1038/s42003-026-10518-z
33. FISH+是一种即用型邻近标记方法,可同时实现RNA可视化和RNA互作蛋白鉴定
Title:FISH+ is a ready-to-use proximity labeling method for simultaneous RNA visualization and RNA-interacting protein identification
Type:研究文章
Time:2026-06-23
Abstracts:传统邻近生物素化方法通常需要大量遗传工程改造或复杂的纯化步骤。本研究提出FISH+,这是一种即用型RNA邻近标记方法,通过将过氧化物酶招募到RNA靶标,在固定细胞中实现原位邻近生物素化。该方法可同时观察RNA分子并鉴定RNA互作蛋白。研究人员利用该方法观察45S和NEAT1 RNA并捕获其邻近蛋白,证明其具备同时进行RNA可视化和邻近蛋白鉴定的能力。通过靶向PNCTR(每个细胞约36个拷贝),研究观察到清晰明亮的RNA斑点,代表RNA及其邻近蛋白在原位产生的综合生物素化信号,提示FISH+可增强RNA可视化效果。研究进一步将FISH+用于探索XIST互作蛋白,发现SPEN、CIZ1和RBM15等多种已报道互作因子显著富集。定量质谱结果显示,FISH+能够准确识别人类细胞核内已知RNA-蛋白相互作用。总体而言,本研究通过整合RNA荧光原位杂交与邻近生物素化,建立了一种用于斑点状RNA的“边看边捕获”方法,为在固定且未进行遗传扰动的样本中表征以RNA为中心的相互作用提供了额外空间信息。
Authors:Lu, Mingxing; Shen, Fenglin; Liu, Yun; He, Xianghuo
作者单位:第一作者单位:中国上海,复旦大学上海医学院肿瘤学系,复旦大学上海癌症中心与生物医学研究院;中国上海,复旦大学生物医学研究院、中国上海,复旦大学基础医学院生物化学与分子生物学系、上海徐汇区中心医院,代谢与分子医学教育部重点实验室也参与了本研究
Doi:10.1038/s42003-026-10509-0
34. 鉴定前列腺癌中参与上皮间质转化和免疫抑制的临床FOXA1突变体靶标
Title:Identification of targets of clinical FOXA1 mutants involved in EMT and immune suppression in prostate cancer
Type:研究文章
Time:2026-06-23
Abstracts:FOXA1是前列腺癌进展中的关键转录因子,作为雄激素受体的先锋因子发挥作用。其表达在前列腺癌晚期升高,并在致癌性重编程中发挥核心作用。FOXA1叉头DNA结合结构域(FKHD)中的复发性编码突变在耐药性转移性前列腺癌中越来越常见,尤其集中在FKHD的Wing2区域。尽管近期研究表明这些突变促进前列腺癌进展,但FKHD突变体的下游靶标仍不清楚。本研究采用三种分析方法阐明这些靶标,包括传统转录组分析、基于染色质结构的超级增强子分析以及免疫反卷积。研究发现,降解硫酸乙酰肝素的酶HPSE是一个可药物干预的靶标,并在体外和体内均被FKHD突变体激活。超级增强子分析进一步显示,FKHD突变体可重塑超级增强子景观,其中FOXP1在多个FOXA1突变体中均表现为持续受超级增强子驱动并上调的基因。此外,在前列腺癌患者样本中,FOXA1突变与免疫抑制相关,抗原加工和呈递关键基因B2M在FKHD突变肿瘤中明显下调。总体而言,这些发现揭示了FOXA1 FKHD突变驱动前列腺癌进展的不同机制,并指出携带这些突变肿瘤中的潜在治疗靶点。
Authors:Dong, Yuxin; Liu, Mingyu; ...; Cai, Changmeng; Gao, Shuai
作者单位:第一作者单位:美国瓦尔哈拉,纽约医学院细胞与分子生理学系
Doi:10.1038/s42003-026-10523-2
35. 特异性对接相互作用介导p38α MAP激酶变构激活的结构与动力学机制
Title:Structural and dynamic insights into the allosteric activation of p38α MAP kinase via specific docking interactions
Type:研究文章
Time:2026-06-23
Abstracts:丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)通过对接相互作用与其对应的激活激酶、失活磷酸酶、底物和支架蛋白结合。造血酪氨酸磷酸酶(HePTP)可去除活化p38α和ERK2中pTyr位点的磷酸基,生成部分活化的单磷酸化MAPK(p38α/pT和ERK2/pT)。本研究报道,p38α/pT的酶活性可通过其与HePTP激酶相互作用基序(KIM)的结合而显著增强,而ERK2/pT则不会。为理解p38α/pT的变构激活,研究解析了非活性p38α与来源于HePTP的KIM肽(pepHePTPm)形成复合物的晶体结构。该研究首次对p38α和ERK2与同一KIM肽的相互作用进行了高分辨率结构比较,并揭示了一种此前未被认识的MAPK与KIM肽相互作用模式。pepHePTPm与p38α C叶结合会诱导激酶铰链区发生特异性构象变化,可能影响ATP与活性位点结合。分子动力学模拟进一步显示,KIM肽结合增加了铰链区的动态柔性,从而促进ATP结合。这些结果为MAPK信号调控提供了新见解,强调了对接诱导的变构变化在调节激酶活性中的作用。
Authors:Zhang, Yuan-Yuan; Pei, Chao-Jun; ...; Wu, Jia-Wei; Wang, Zhi-Xin
作者单位:第一作者单位:中国江苏苏州,苏州大学苏州医学院生命科学学院,分子酶学研究所,生物医学基础研究中心,老年疾病与免疫学教育部重点实验室;中国北京,清华大学生命科学学院,蛋白质科学教育部重点实验室也参与了本研究
Doi:10.1038/s42003-026-10502-7
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审核:PsyBrain 脑心前沿编辑部
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