从“鉴定更多”到“数据更可信”：重新定义血浆蛋白质组评价标准

从血浆大队列到各类样本，贝普奥 SISPROT®产品矩阵覆盖全场景蛋白质组学前处理需求

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鉴定深度不等于数据质量：

血浆蛋白质组学的关键痛点

2026 年 4 月，Nature Biotechnology上发表一篇 Comment：Deeper is not always better in plasma proteomics，文章指出蛋白鉴定数高不等于数据质量好。细胞污染（血小板/红细胞/PBMC）会导致非血浆来源的蛋白被错误鉴定，虚增蛋白鉴定数。

因此，血浆蛋白质组学的核心痛点并非单纯“鉴定量不够多”，而是如何在去除高丰度蛋白干扰的同时，分辨真实血浆蛋白与细胞污染，并保持重复性和功能蛋白覆盖。

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PlasmaG：破壁低丰度蛋白，解锁血浆真数据

深圳市贝普奥生物科技有限公司（BayOmics）推出的血浆专用试剂盒——PlasmaG，基于自研SISPROT®（Simple and Integrated Spintip-based Proteomics Technology）技术。2016 年首次报道的 SISPROT® 以独特的离心移液枪头“Spintip”为核心，集成蛋白预富集、还原、烷基化、酶解和除盐等步骤为一体，从原始样品出发可获得纯净多肽。PlasmaG 在此基础上，引入磁性微球，精准捕获血浆低丰度蛋白，并无缝衔接 SISPROT®流程，直接输出纯净多肽，专为血浆蛋白质组研究提供全链条解决方案。

图1. SISPROT® PlasmaG 血浆蛋白质组学样本前处理流程

技术亮点

• 5000+新鲜血浆蛋白鉴定量；

• 99%高丰度蛋白高效去除，低丰度蛋白（分泌蛋白 & EV Marker)精准捕获；

• 3 项污染指数优于竞品血小板（PLT）、血细胞（RBC）和外周血细胞（PBMCs）污染指数低于安全阈值；

• r＞0.93不同批次 Pearson 相关性。

图2A. 不同年份血浆样本蛋白鉴定量

*Human Plasma, Orbitrap Exploris™ 480, DIA, DIA-NN

图2B. 两种方案差异蛋白的来源组成

图2C. 血小板、红细胞和 PBMC 污染指数（CI）；污染指数(CI)：基于 Geyer et al. 2019 (EMBO Mol Med)提出定量公式。

*HumanPlasma, Astral zoom, DIA, Spectronaut

图2D. Pearson 相关性

*FBS, Orbitrap Exploris™ 240, DIA, Spectronaut

03

SISPROT 产品矩阵

PlasmaG 是 BayOmics SISPROT® 系列专为血浆蛋白质组学打造的重磅新品，聚焦高动态范围、细胞污染和大队列重复性问题。与此同时，BayOmics 同步提供通用方案 SISPROT®SP3，全新 SISPROT®SE Essential、SISPROT®FLEX Essential，与超微量 SISPROT® PAC 共同构成 BayOmics 全场景的前处理产品矩阵。

全新上市｜SISPROT® SP3

经典 SP3 磁珠体系与 SISPROT 流程深度融合，零门槛上手高效前处理

●痛点：在蛋白质组学实验中，高效分离蛋白质与小分子（如盐离子、去污剂、有机小分子等）是确保质谱分析灵敏度和准确性的关键环节。传统甲醇-氯仿或丙酮沉淀需要反复离心与干燥，容易造成蛋白聚集和低丰度组分损失；FASP 存在膜吸附、步骤多和微量样本处理困难等问题。

●解决方案：单管固相增强样品制备技术（single-pot, solid-phase-enhanced sample-preparation，SP3）通过磁珠表面动态亲水作用直接捕获蛋白质，贝普奥生物将 SP3 技术与 SISPROT®流程联合，将清洗后的含蛋白磁珠被转移至反相固相萃取小柱酶解和多肽脱盐，得到纯净多肽样本，规避传统多步骤分离的样本损失与操作误差，显著提升了实验通量和数据重复性。

●技术亮点：

• 5-20 μg常规样本单次处理所需蛋白量；

• 10 μg / 5500+10 μg 组织样本平均鉴定超过 5500 种蛋白；

• 操作简便仅需磁力架和离心机，新手小白也可轻松上手；

• 适用体系广适合多种缓冲盐体系，包含 SDS、尿素等强变性体系。

图3. 蛋白鉴定量

迭代升级｜SISPROT® SE Essential & SISPROT® FLEX Essential

常规样本标准化前处理，核心流程和质量标准延续

自2023年推出以来，SISPROT® SE与FLEX 已形成稳定用户基础，在医学研究、基础生物学和药物开发等领域得到广泛应用，并收获一致好评。为进一步提升标准化流程的可及性，让高质量前处理覆盖更多实验室，我们对成熟 SE/FLEX产品线进行了全面版本升级，推出Essential（Ess）版本，核心试剂体系、流程控制和质量标准保持延续，精简耗材配置、采用大包装规格，让用户在批量项目中获得更友好的价格体验。

轻装上阵，质控如一！

●技术亮点：

• 2.5 小时完成样本前处理全部步骤；

• 1-10 μg常规样本单次处理所需蛋白量；

• 4 μg / 7500+4 μg 细胞样本平均鉴定超过 7500 种蛋白；

• >99.99%专利 SDS 清洗试剂，SDS 去除率 >99.99%。

图4. 蛋白鉴定量

●SE Ess 适用样本：细胞、外泌体、IP 溶液、血液、尿液等体液样本

●FLEX Ess 适用样本：动物组织、穿刺组织、植物组织、FFPE、细胞、外泌体、蛋白溶液、尿液、泪液、血液等体液样本，同时兼容 SDS 强变性剂体系

超微量方案｜SISPROT® PAC

面向纳克级蛋白、少量细胞和 LCM 组织

●痛点：面对激光显微切割 LCM 组织和少量细胞的总蛋白量极低问题，常规多步骤前处理中的每一次转移和管壁吸附都会造成不可逆的蛋白损失，不仅直接导致鉴定覆盖度骤降，还会因损失比例不稳定而严重损害批次间的技术重复性。

●解决方案：PAC 专为纳克级样本设计，将蛋白提取、酶解和除盐集成于同一微量化反应体系内，从根本上消除中间转移步骤；同时针对超微量样本优化反应体积与酶解条件，在减少样本损失的同时，确保低丰度蛋白的充分释放与高效酶解，实现覆盖度与重复性的双重保障。

●技术亮点：

• 1 ng / 3500+1 ng 蛋白样本可稳定检测约 3500 种蛋白；

• 5 小时 / 24 样本完成 24 个超微量样本前处理；

• <0.1 mm²LCM 组织样本；0.5×10³-10⁵ 个超微量细胞。

图5. 蛋白鉴定量

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参考文献：

1. Gao H, Korff K, Mann M, Guo T. Deeper is not always better in plasma proteomics. Nature Biotechnology. 2026;44:897–900. doi:10.1038/s41587-026-03106-3.

2. Gao H, et al. Systematic evaluation of blood contamination in nanoparticle-based plasma proteomics. EMBO Molecular Medicine. 2026;18:275–296. doi:10.1038/s44321-025-00346-9.

3. Geyer PE, et al. Plasma Proteome Profiling to detect and avoid sample-related biases in biomarker studies. EMBO Molecular Medicine. 2019;11:e10427.

4. Korff K, et al. Pre-analytical drivers of bias in bead-enriched plasma proteomics. EMBO Molecular Medicine. 2025;17:3174–3196.

5. Chen W, et al. Simple and integrated spintip-based technology applied for deep proteome profiling. Analytical Chemistry. 2016;88(9):4864–4871.

6. Hughes, C.S, et al. Single-pot, solid-phase-enhanced sample preparation for proteomics experiments. Nature Protocols, 2019; 14: 68-85.