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AI4S大牛顾全全创业公司Geodesic Intelligence亮相,瞄准药物发现

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编辑丨ScienceAI

今天,科学智能(AI4S)领域知名学者顾全全宣布正式创业,公司Geodesic Intelligence正式亮相。Geodesic Intelligence旨在为药物发现打造 AGI,找到从生物学到药物的最短路径。



Geodesic Intelligence不是传统意义上的「AI 制药公司」,而是致力于围绕蛋白质疗法,为药物发现构建 AI 原生平台。



官网链接:https://geodesiclab.com/

与公司成立消息同时发布的,是他们的平台 NovaDDE、模型 NovaAtom 与实验室 NovaLab。Geodesic Intelligence 尝试把生物学基础模型和实验科学放到同一条技术链中,尽可能缩短从生物学问题到药物的路径。

药物发现AI原生平台NovaDDE

NovaDDE 是一个基于 AI 的科学推理与药物发现平台,覆盖从靶点识别到先导候选物确定的完整流程,负责规划、执行和评估药物发现工作,并以生物学、结构生物学和生物物理学为研究基础。它将前沿 AI、科学知识、专业生物模型和计算工具连接成一个统一的智能体系统,专为复杂的科学工作而构建。



图示:NovaDDE 的使用演示。

其工作原理是将药物发现中需要的跨文献、生物证据、分子结构、计算模型和专业工具等能力进行汇总,使科学家能够从科学问题转向分析、计算和更有操作性的技术洞察。

也就是说,科学家提出一个问题之后,NovaDDE 先拆解问题,再搜索相关文献和生物学信息,调用专业模型和计算工具,分析中间结果,然后继续执行后续步骤。



图示:NovaDDE 汇聚的多层面智能功能。

NovaAtom-Lite模型

Geodesic 此次发布的NovaAtom-Lite是 NovaAtom 家族的首个模型,为下一代蛋白质结构预测模型提供了初步展示。该模型设计为轻量且高效的版本,可在实现快速推理的同时,为后续更大规模的 NovaAtom 模型奠定基础。



图示:NovaAtom-Lite 预览。

根据定位,NovaAtom 将会是一个全原子结构预测器,它能根据生物分子组装的序列预测其中每个重原子的位置,并为每个残基及每一对残基提供校准后的置信度。

在原子层面的扩散过程中,将会有一个可回收的配对形成器与之结合:主体读取序列、进化比对以及可选的结构模板,以构建整个组装的表示,而扩散模型则基于此生成相应的坐标。

模型可整合的分子涵盖蛋白质、DNA、RNA、各类小分子配体,可提出约束条件包括环肽、大环结构、共价修饰等。返回内容更为详细,相关指标囊括坐标、置信度预期误差等多种数据结构。

Geodesic 正积极扩展 NovaAtom 系列的模型容量和计算能力。目前,大模型正处于训练阶段,同时正在进行更广泛的基准测试和校准研究。

NovaLab实验室

NovaLab 是 Geodesic 内部的湿实验室,旨在通过快速的实验验证和迭代,将 AI 模型直接连接到物理世界。

每一种由 AI 设计的结合物进入 NovaLab 之后,都会经过一个结构化流程,旨在回答难度逐步上升的各类问题:制造可行性、设计匹配度、可结合性与结合效果、信号稳定性、治疗可行性与最重要的有效性。



图示:NovaLab 的实验循环。

Geodesic 对 NovaLab 的期望是打造一个计算智能与生物现实间的循环,让每一个循环变得更加快速、更具信息量,并具备更强的能力——从而加速从生物学理念到新药研发的进程。

药物发现创业

顾全全是机器学习理论、大模型对齐以及 AI4S 领域知名的学者。他于 2007 年和 2010 年分获清华大学自动化专业学士、控制科学与工程硕士学位,2014 年获伊利诺伊大学香槟分校计算机科学博士学位,随后在普林斯顿大学运筹与金融工程系(ORFE)开展统计学博士后研究。



2015 年,顾全全赴弗吉尼亚大学任教,2018 年加入 UCLA 计算机科学系,2022 年 7 月正式晋升为终身副教授(Associate Professor with Tenure),领导该校 AGI 实验室。后来,他于 2023 年加入字节 Seed,成为 Seed 旗下聚焦科学智能领域的 AI4S 团队核心成员。

今年 6 月,顾全全发文宣布从字节离职。彼时就有传闻称他将投身于药物发现创业。如今,靴子终于落地了。

https://x.com/QuanquanGu/status/2097760765810024671

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