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数十亿序列沉睡,谷歌用AI挖出抗菌肽新分子

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全球数据库里躺着数十亿条天然氨基酸序列,绝大多数功能未被标注,处于"暗物质"状态。与此同时,抗生素耐药性问题不断加剧,新药研发却缓慢且繁琐。这两件事之间,谷歌想用AI搭一座桥。

谷歌推出的 Google Antigravity 智能开发平台,正在尝试把抗菌肽的发现流程压缩。研究人员已经通过它发现了一种新型抗菌肽候选分子,预测其对呼吸道感染病原体具有活性。目前,该候选分子正在进行湿实验室验证。


从"暗物质"里找答案

抗菌肽,尤其是细菌素,被视为传统抗生素很有前景的替代品。这类物质天然进化出靶向细菌基础弱点的能力,病原体很难对其产生耐药性。问题在于,全球数据库中积累的数十亿条天然氨基酸序列,大量功能未被标注,想从中筛选出有用的分子,如同大海捞针。

Antigravity 平台借助 ProtNLM 模型来应对这一难题。该模型可以直接读取氨基酸序列的进化"语法",从原始蛋白质序列预测生物功能,为大量 UniProt 条目添加了高置信度功能标注。研究人员因此可以扫描 UniProt 数据库中数百万未表征的蛋白质,而不必依赖逐个实验验证。

把数天的筛选压进一次会话

传统模式下,生物学家需要跨多个数据库分散搜索,流程冗长。Antigravity 提供的智能科学工作台,将这一过程整合到单次会话中,支持快速发现、结构评估和筛选潜在靶点。

平台内置了 Biomolecular Structure Viewer 三维可视化工具。研究者和智能体可以在共享的3D画布上协作:智能体从 AlphaFold 数据库获取结构,动态驱动可视化,高亮关键功能区域;研究者也可以在3D空间标记感兴趣区域,向智能体提出问题,实现基于结构的交互式研究。

在这种协作模式中,分工是明确的:

  • 研究者设定生物学目标、把控研究策略
  • 智能体负责跨数据库协调、结构分析和文献综合等繁重工作

原本需要数天的分散数据库筛选,被压缩为单次协作会话。过往这类研发工作需要依赖分散的专业软件,而 Antigravity 将完整的科学推理流程整合在一处,帮助研究人员更高效地遍历广阔的生物搜索空间,筛选出高置信度候选分子。

对科学家来说,省下来的时间可以投入到高质量假设验证和实验研究中。抗菌肽只是这条路径上的第一个验证场景,但它指向的逻辑很清晰:当数十亿条序列不再沉睡,新药发现的起点就被往前挪了一步。

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