瑞士生物科技企业Aukera Therapeutics研发针对RAPTOR蛋白的高选择性小分子抑制剂

图源Aukera Therapeutics

钛媒体APP注：自2011年以来，瑞士连续15年全球创新指数排名第一，是全球重要的创新策源地，也是中国首个创新战略伙伴关系国，在创新发展领域与中国具有极佳互补性。 由Venturelab主办的“瑞士创新100强”，汇聚了最佳“瑞士制造”的初创及成长期科技创新企业，是瑞士最具国际影响力的创新生态标杆。自2011年以来，该榜单每年在瑞士全国范围内评选出100家最具开创性和市场前景的瑞士创新企业和25家最具独角兽潜力的瑞士成长期企业，覆盖生命科学、工程机械、机器人、信息通信、低碳科技、食品科技等领域。 为了全方位展示和介绍瑞士最前沿的创新科技，钛媒体APP与Venturelab的中国授权合作方以明科技（Insight Tech）合作推出《瑞士创新100强》专题，全面展示瑞士先锋科创生态的全景。 本文为专栏第215期，介绍的Aukera Therapeutics是2025年《瑞士创新100强》上榜企业，其致力于研发针对RAPTOR蛋白的高选择性小分子抑制剂。

瑞士生物科技公司Aukera Therapeutics（以下简称Aukera）成立于2021年，公司致力于研发针对RAPTOR蛋白的高选择性小分子抑制剂。该抑制剂可选择性作用于mTORC1通路，抑制其异常过度激活，同时避免影响其他正常mTOR信号，用于结节性硬化症等mTORC相关疾病的治疗。

Aukera是巴塞尔大学的衍生公司，由Stefan Imseng与Dritan Liko共同创立。Stefan Imseng为公司首席执行官，拥有巴塞尔大学生命科学博士学位，曾在巴塞尔大学生物中心从事mTOR相关研究。Dritan Liko为公司生物学负责人，负责 mTOR 生物学、候选药物的生物学验证及临床前研究。

图源Biozentrum

mTOR是一种存在于人体细胞内的重要信号蛋白，主要通过形成mTORC1和mTORC2两类蛋白复合物发挥作用，负责根据营养、能量和生长因子等信息调节细胞生长、蛋白质合成和代谢活动。其中mTORC1的活性异常与多种病理状况相关，如癌症、神经退行性疾病和罕见病等。现有mTOR抑制剂虽然已经用于部分癌症、器官移植及相关疾病治疗，但普遍存在选择性不足的问题。由于mTOR同时形成mTORC1和mTORC2等不用信号复合物，传统药物往往直接作用于mTOR本身，难以只针对异常激活的mTORC1，因此在抑制致病信号的同时，也容易干扰细胞生长、蛋白质合成、能量代谢和免疫调节等正常生理功能，长期使用可能带来代谢紊乱、免疫功能受影响等副作用。

图源Aukera Therapeutics

Aukera基于AI蛋白质设计和药物发现，筛选了数十亿种化合物并对其进行优化，最终发现了一种高选择性的RAPTOR（mTOR调节相关蛋白）抑制剂。该抑制剂可精准调节mTORC1信号通路，降低异常通路活性并减少对正常mTOR信号的干扰，用于治疗结节性硬化症等mTORC1异常激活相关疾病。

结节性硬化症是一种罕见的多系统遗传性疾病，通常在婴儿期发病，会导致癫痫发作和一系列神经精神症状。结节性硬化症基因突变会过度激活mTORC1，导致大脑神经元过度兴奋。

Aukera构建了一个AI药物发现模型，能够设计新型药物，选择性地靶向mTOR通路的不同分支。Aukera首先系统分析了mTORC1蛋白复合物的组成、三维结构、蛋白相互作用关系及信号调控机制，从中识别具有选择性的调控蛋白及可利用的结构位点，并借助蛋白工程和结构生物学方法建立了可靠的药物靶点体系。在此基础上，Aukera运用该AI药物发现模型，对数十亿种化合物进行模拟筛选，根据分子的空间构型、电荷分布和化学性质预测其与目标蛋白的结合能力，快速锁定高潜力候选分子。随后，这些候选分子会通过生化和细胞实验验证其实际结合能力、信号调节效果、选择性及毒性，实验数据会反馈至计算模型，再结合药物化学进行分子设计、合成、测试和优化的多伦迭代，持续提升候选分子的活性、稳定性、体内暴露和安全性。

基于此，Aukera研发出针对RAPTOR蛋白的高选择性小分子抑制剂。RAPTOR是mTORC1蛋白复合物中的关键调控蛋白，主要参与mTORC1的形成、底物识别及信号传递，对维持mTORC1活性具有重要作用。该抑制剂通过与RAPTOR特定结构区域结合，干预其在mTORC1中的调控功能，从而降低mTORC1信号活性。与传统直接作用于mTOR蛋白本身的抑制剂相比，RAPTOR仅存在于mTORC1这一信号复合物中，能够更有针对性地调节mTORC1，减少对mTORC2及其他正常mTOR信号的影响。目前，该抑制剂主要针对结节性硬化症，有望降低癫痫发作的频率和严重程度，其未来应用范围可拓展至神经退行性疾病、代谢性疾病和衰老相关疾病。

目前，Aukera已累计融资450万瑞士法郎，投资者包括BaseLaunch、巴塞尔大学Innovation Office、Innosuisse、Kickfund与苏黎世州银行等，资金主要用于推进抑制剂的药物发现、候选分子优化及临床前有效性研究。

图源以明科技

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