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翻译组学各类物种Polysome Profiling多聚核糖体分析全系列技术介绍

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01

前言

想深入了解基因的翻译状态?想捕捉调控翻译的动态过程?新使生物现推出3种多聚核糖体分析(Polysome profiling)服务,帮您全面解析转录后调控的核心环节——翻译!

我们引进最新的全自动密度梯度制备与核糖体分选一体机,制备蔗糖密度梯度分离多聚核糖体,绘制多聚核糖体图谱,适用于哺乳动物、植物及真菌等多物种样品类型的分析。

02

技术原理

一般来说,翻译越旺盛,结合在一条mRNA上的核糖体数量就越多,蔗糖梯度离心时的沉降速率越快,因此可以通过沉降系数的差异将结合不同数量核糖体的mRNA通过离心进行分离,比较不同组分中蛋白和转录本的差异。


03

服务项目

1. Polysome profiling 多聚核糖体分析

通过蔗糖密度梯度离心分离核糖体单体(monosome)与多聚核糖体(polysomes),结合吸光曲线分析整体翻译状态。


适用场景:

1. 评估整体翻译活性(global translation)

2. 比较处理组与对照组中不同核糖体数量对应组分的变化

3. 快速捕捉细胞整体翻译趋势

交付内容:

1. 实验原始数据图像

2. 绘制多聚核糖体图谱

3. 返还各组分

2. Polysome-seq 多聚核糖体结合转录本测序

在经典polysome profiling的基础上,提取多聚核糖体各组分样本中的RNA,进行RNA-seq测序,深入分析特定mRNA的翻译状态和多聚核糖体分布特征。


适用场景:

1. 精细解析特定基因的翻译情况

2. 比较样本中不同基因的核糖体负载(ribosome load)

3. 探索翻译调控机制与调控因子作用

交付内容:

1. 实验原始数据图像

2. 绘制多聚核糖体图谱

3. 原始测序数据

4. 标准化分析

5. 结题报告

3. 酶切-Polysome profiling

在polysome profiling基础上进行酶切处理,可打断未保护的mRNA,仅保留被核糖体保护的片段,通过发现核糖体二聚体(disome)或三聚体(trisome)的变化来测核糖体碰撞(collision)与翻译停滞(stalling)现象。


适用场景:

1. 发现及验证核糖体碰撞

2. 研究核糖体碰撞与质量控制机制

3. 研究翻译调控因子的功能

交付内容:

1. 实验原始数据图像

2. 绘制曲线对比图(对照/处理组的单核糖体/双核糖体变化图)

3. 后续可选超高分辨率Disome-seq双核糖体印迹分析测序

04

实测数据展示

1. Polysome profiling 多聚核糖体分析


哺乳动物样本峰图


植物样本峰图


真菌样本峰图

2. Polysome-seq 多聚核糖体结合转录本测序


分选后不同组分RNA-seq差异基因分析

3. 酶切-Polysome Profiling


不同酶切条件下各组分峰图变化

05

技术优势

1. 适用多物种:哺乳动物、植物、真菌

2. 适配多种细胞系与组织样本

06

平台优势

1. 新使生物拥有全套最新的核糖体分选仪器和丰富的技术经验。

2. 一站式服务:后续客户可选择结合对mRNA到蛋白质之间翻译调控进行研究。

3. 专业翻译组领域科研团队全程指导及售后。

新使生物专业翻译组学技术平台

新使生物NeoRibo长期专注于翻译组学技术研发与应用,已构建覆盖核糖体翻译、tRNA解码、RNA修饰及Poly(A)尾调控等多个层面的技术体系,提供从整体翻译活性、基因翻译效率到密码子分辨率翻译行为的系统解决方案,全面解析转录后及翻译过程中的精细调控机制。


新使生物专业翻译组一站式服务平台
产品名称

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